Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEFLP07196 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEFLP07196 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEFLP07196 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NEFLP07196 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEFLP07196 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NEFLP07196 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEFLP07196 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEFLP07196 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEFLP07196 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEFLP07196 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEFLP07196 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEFLP07196 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEFLP07196 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEFLP07196 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEFLP07196 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEFLP07196 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEFLP07196 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEFLP07196 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEFLP07196 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEFLP07196 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEFLP07196 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEFLP07196 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEFLP07196 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEFLP07196 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEFLP07196 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEFLP07196 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEFLP07196 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEFLP07196 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEFLP07196 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NEFLP07196 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEFLP07196 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NEFLP07196 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NEFLP07196 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NEFLP07196 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NEFLP07196 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEFLP07196 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEFLP07196 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEFLP07196 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEFLP07196 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NEFLP07196 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEFLP07196 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEFLP07196 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEFLP07196 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEFLP07196 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEFLP07196 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEFLP07196 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEFLP07196 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEFLP07196 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEFLP07196 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEFLP07196 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEFLP07196 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEFLP07196 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEFLP07196 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEFLP07196 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEFLP07196 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEFLP07196 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEFLP07196 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEFLP07196 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEFLP07196 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEFLP07196 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEFLP07196 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEFLP07196 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEFLP07196 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEFLP07196 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEFLP07196 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEFLP07196 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NEFLP07196 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEFLP07196 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEFLP07196 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEFLP07196 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEFLP07196 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEFLP07196 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEFLP07196 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEFLP07196 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEFLP07196 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEFLP07196 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEFLP07196 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEFLP07196 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEFLP07196 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEFLP07196 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEFLP07196 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEFLP07196 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEFLP07196 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEFLP07196 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEFLP07196 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEFLP07196 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEFLP07196 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEFLP07196 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEFLP07196 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEFLP07196 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEFLP07196 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NEFLP07196 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEFLP07196 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEFLP07196 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NEFLP07196 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEFLP07196 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEFLP07196 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEFLP07196 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEFLP07196 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms