Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG7O95352 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG7O95352 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG7O95352 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG7O95352 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG7O95352 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG7O95352 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG7O95352 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG7O95352 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG7O95352 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATG7O95352 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATG7O95352 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATG7O95352 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATG7O95352 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATG7O95352 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATG7O95352 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATG7O95352 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATG7O95352 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATG7O95352 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATG7O95352 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATG7O95352 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATG7O95352 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATG7O95352 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATG7O95352 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATG7O95352 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATG7O95352 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATG7O95352 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATG7O95352 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATG7O95352 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATG7O95352 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATG7O95352 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATG7O95352 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATG7O95352 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATG7O95352 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATG7O95352 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATG7O95352 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATG7O95352 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATG7O95352 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATG7O95352 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATG7O95352 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATG7O95352 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATG7O95352 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATG7O95352 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG7O95352 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG7O95352 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG7O95352 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG7O95352 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG7O95352 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG7O95352 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG7O95352 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG7O95352 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG7O95352 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG7O95352 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG7O95352 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG7O95352 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG7O95352 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG7O95352 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG7O95352 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG7O95352 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG7O95352 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG7O95352 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG7O95352 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG7O95352 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG7O95352 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG7O95352 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG7O95352 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG7O95352 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG7O95352 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG7O95352 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG7O95352 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG7O95352 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG7O95352 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG7O95352 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG7O95352 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG7O95352 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG7O95352 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG7O95352 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG7O95352 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG7O95352 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG7O95352 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG7O95352 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG7O95352 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG7O95352 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG7O95352 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG7O95352 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG7O95352 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG7O95352 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG7O95352 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG7O95352 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG7O95352 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG7O95352 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG7O95352 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG7O95352 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG7O95352 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG7O95352 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG7O95352 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG7O95352 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG7O95352 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG7O95352 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG7O95352 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms