Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRMUO75648 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRMUO75648 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRMUO75648 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRMUO75648 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRMUO75648 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRMUO75648 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRMUO75648 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TRMUO75648 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRMUO75648 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRMUO75648 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRMUO75648 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRMUO75648 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRMUO75648 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRMUO75648 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRMUO75648 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRMUO75648 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRMUO75648 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRMUO75648 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRMUO75648 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRMUO75648 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRMUO75648 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRMUO75648 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRMUO75648 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRMUO75648 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRMUO75648 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRMUO75648 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRMUO75648 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRMUO75648 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRMUO75648 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRMUO75648 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRMUO75648 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRMUO75648 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRMUO75648 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRMUO75648 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRMUO75648 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRMUO75648 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRMUO75648 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRMUO75648 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRMUO75648 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRMUO75648 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRMUO75648 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRMUO75648 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRMUO75648 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRMUO75648 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRMUO75648 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRMUO75648 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRMUO75648 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRMUO75648 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRMUO75648 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRMUO75648 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRMUO75648 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRMUO75648 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRMUO75648 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRMUO75648 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRMUO75648 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRMUO75648 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRMUO75648 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRMUO75648 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRMUO75648 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRMUO75648 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRMUO75648 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRMUO75648 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRMUO75648 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRMUO75648 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TRMUO75648 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRMUO75648 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRMUO75648 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRMUO75648 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRMUO75648 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRMUO75648 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRMUO75648 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRMUO75648 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRMUO75648 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRMUO75648 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRMUO75648 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRMUO75648 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRMUO75648 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRMUO75648 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRMUO75648 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRMUO75648 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRMUO75648 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRMUO75648 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRMUO75648 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRMUO75648 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRMUO75648 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TRMUO75648 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TRMUO75648 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRMUO75648 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TRMUO75648 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRMUO75648 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRMUO75648 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRMUO75648 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRMUO75648 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRMUO75648 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRMUO75648 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRMUO75648 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRMUO75648 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRMUO75648 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRMUO75648 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms