Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms