Protein–RNA interactions for Protein: O60308

CEP104, Centrosomal protein of 104 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP104O60308 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEP104O60308 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEP104O60308 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEP104O60308 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEP104O60308 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEP104O60308 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEP104O60308 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEP104O60308 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEP104O60308 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEP104O60308 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEP104O60308 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEP104O60308 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEP104O60308 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CEP104O60308 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEP104O60308 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEP104O60308 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEP104O60308 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEP104O60308 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEP104O60308 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEP104O60308 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEP104O60308 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CEP104O60308 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEP104O60308 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEP104O60308 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEP104O60308 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEP104O60308 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEP104O60308 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEP104O60308 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEP104O60308 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEP104O60308 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEP104O60308 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEP104O60308 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEP104O60308 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEP104O60308 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEP104O60308 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP104O60308 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP104O60308 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP104O60308 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP104O60308 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP104O60308 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP104O60308 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP104O60308 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP104O60308 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP104O60308 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP104O60308 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP104O60308 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP104O60308 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP104O60308 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP104O60308 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP104O60308 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP104O60308 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP104O60308 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP104O60308 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP104O60308 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP104O60308 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP104O60308 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP104O60308 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP104O60308 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP104O60308 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP104O60308 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP104O60308 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP104O60308 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP104O60308 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP104O60308 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP104O60308 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP104O60308 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP104O60308 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP104O60308 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP104O60308 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP104O60308 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP104O60308 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP104O60308 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP104O60308 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP104O60308 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP104O60308 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP104O60308 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP104O60308 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP104O60308 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP104O60308 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP104O60308 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP104O60308 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP104O60308 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP104O60308 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP104O60308 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP104O60308 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP104O60308 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP104O60308 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP104O60308 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP104O60308 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP104O60308 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP104O60308 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP104O60308 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP104O60308 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP104O60308 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP104O60308 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP104O60308 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP104O60308 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP104O60308 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP104O60308 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP104O60308 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms