Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CREB3O43889 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CREB3O43889 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CREB3O43889 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CREB3O43889 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CREB3O43889 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CREB3O43889 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CREB3O43889 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CREB3O43889 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CREB3O43889 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CREB3O43889 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CREB3O43889 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CREB3O43889 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CREB3O43889 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CREB3O43889 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CREB3O43889 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CREB3O43889 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CREB3O43889 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CREB3O43889 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CREB3O43889 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CREB3O43889 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CREB3O43889 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CREB3O43889 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CREB3O43889 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CREB3O43889 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CREB3O43889 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CREB3O43889 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CREB3O43889 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CREB3O43889 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CREB3O43889 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CREB3O43889 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CREB3O43889 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CREB3O43889 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CREB3O43889 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CREB3O43889 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CREB3O43889 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CREB3O43889 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CREB3O43889 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CREB3O43889 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CREB3O43889 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CREB3O43889 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CREB3O43889 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CREB3O43889 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CREB3O43889 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CREB3O43889 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CREB3O43889 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CREB3O43889 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CREB3O43889 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CREB3O43889 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CREB3O43889 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CREB3O43889 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CREB3O43889 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CREB3O43889 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CREB3O43889 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CREB3O43889 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CREB3O43889 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CREB3O43889 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CREB3O43889 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CREB3O43889 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CREB3O43889 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CREB3O43889 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CREB3O43889 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CREB3O43889 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CREB3O43889 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CREB3O43889 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CREB3O43889 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CREB3O43889 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CREB3O43889 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CREB3O43889 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CREB3O43889 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CREB3O43889 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CREB3O43889 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CREB3O43889 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CREB3O43889 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CREB3O43889 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CREB3O43889 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CREB3O43889 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CREB3O43889 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CREB3O43889 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CREB3O43889 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CREB3O43889 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CREB3O43889 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CREB3O43889 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CREB3O43889 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CREB3O43889 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CREB3O43889 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CREB3O43889 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CREB3O43889 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CREB3O43889 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CREB3O43889 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CREB3O43889 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CREB3O43889 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CREB3O43889 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB3O43889 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB3O43889 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB3O43889 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB3O43889 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB3O43889 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB3O43889 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB3O43889 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms