Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DENRO43583 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DENRO43583 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DENRO43583 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DENRO43583 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DENRO43583 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DENRO43583 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DENRO43583 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DENRO43583 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DENRO43583 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DENRO43583 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DENRO43583 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DENRO43583 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DENRO43583 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DENRO43583 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DENRO43583 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DENRO43583 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DENRO43583 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DENRO43583 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DENRO43583 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DENRO43583 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DENRO43583 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DENRO43583 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DENRO43583 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DENRO43583 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DENRO43583 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DENRO43583 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DENRO43583 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DENRO43583 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DENRO43583 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DENRO43583 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DENRO43583 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DENRO43583 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DENRO43583 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DENRO43583 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DENRO43583 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
DENRO43583 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DENRO43583 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DENRO43583 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DENRO43583 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DENRO43583 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DENRO43583 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DENRO43583 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DENRO43583 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DENRO43583 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DENRO43583 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DENRO43583 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DENRO43583 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DENRO43583 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DENRO43583 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DENRO43583 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DENRO43583 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DENRO43583 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DENRO43583 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DENRO43583 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DENRO43583 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DENRO43583 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DENRO43583 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DENRO43583 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DENRO43583 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DENRO43583 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DENRO43583 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DENRO43583 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DENRO43583 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DENRO43583 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DENRO43583 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DENRO43583 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DENRO43583 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DENRO43583 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DENRO43583 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DENRO43583 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DENRO43583 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DENRO43583 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DENRO43583 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DENRO43583 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DENRO43583 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DENRO43583 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DENRO43583 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DENRO43583 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DENRO43583 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DENRO43583 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DENRO43583 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DENRO43583 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DENRO43583 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DENRO43583 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DENRO43583 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DENRO43583 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DENRO43583 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DENRO43583 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DENRO43583 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DENRO43583 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DENRO43583 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DENRO43583 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DENRO43583 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DENRO43583 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DENRO43583 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DENRO43583 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DENRO43583 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DENRO43583 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DENRO43583 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms