Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KCNQ3O43525 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KCNQ3O43525 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KCNQ3O43525 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KCNQ3O43525 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNQ3O43525 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNQ3O43525 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNQ3O43525 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNQ3O43525 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNQ3O43525 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNQ3O43525 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNQ3O43525 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNQ3O43525 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNQ3O43525 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNQ3O43525 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNQ3O43525 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNQ3O43525 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNQ3O43525 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNQ3O43525 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNQ3O43525 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNQ3O43525 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNQ3O43525 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNQ3O43525 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNQ3O43525 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNQ3O43525 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNQ3O43525 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNQ3O43525 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNQ3O43525 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNQ3O43525 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNQ3O43525 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNQ3O43525 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNQ3O43525 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNQ3O43525 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNQ3O43525 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNQ3O43525 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNQ3O43525 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNQ3O43525 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNQ3O43525 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNQ3O43525 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNQ3O43525 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNQ3O43525 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNQ3O43525 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNQ3O43525 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNQ3O43525 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNQ3O43525 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNQ3O43525 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNQ3O43525 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNQ3O43525 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNQ3O43525 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNQ3O43525 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNQ3O43525 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNQ3O43525 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNQ3O43525 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNQ3O43525 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNQ3O43525 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNQ3O43525 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNQ3O43525 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNQ3O43525 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNQ3O43525 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNQ3O43525 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNQ3O43525 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNQ3O43525 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNQ3O43525 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNQ3O43525 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNQ3O43525 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNQ3O43525 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNQ3O43525 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNQ3O43525 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNQ3O43525 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNQ3O43525 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms