Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

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Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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CEP290O15078 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CEP290O15078 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CEP290O15078 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CEP290O15078 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CEP290O15078 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CEP290O15078 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CEP290O15078 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CEP290O15078 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CEP290O15078 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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CEP290O15078 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CEP290O15078 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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CEP290O15078 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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CEP290O15078 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CEP290O15078 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CEP290O15078 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CEP290O15078 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CEP290O15078 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CEP290O15078 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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CEP290O15078 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
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CEP290O15078 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CEP290O15078 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CEP290O15078 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CEP290O15078 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CEP290O15078 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CEP290O15078 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CEP290O15078 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CEP290O15078 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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