Protein–RNA interactions for Protein: I3L0D1

RBAK-RBAKDN, HCG1647537, isoform CRA_b, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RBAK-RBAKDNI3L0D1 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RBAK-RBAKDNI3L0D1 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RBAK-RBAKDNI3L0D1 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
RBAK-RBAKDNI3L0D1 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RBAK-RBAKDNI3L0D1 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RBAK-RBAKDNI3L0D1 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms