Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E9PBE3 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E9PBE3 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
E9PBE3 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E9PBE3 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E9PBE3 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E9PBE3 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E9PBE3 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E9PBE3 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E9PBE3 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E9PBE3 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E9PBE3 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E9PBE3 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E9PBE3 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E9PBE3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E9PBE3 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
E9PBE3 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E9PBE3 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E9PBE3 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E9PBE3 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E9PBE3 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E9PBE3 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
E9PBE3 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E9PBE3 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E9PBE3 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E9PBE3 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E9PBE3 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E9PBE3 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E9PBE3 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E9PBE3 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E9PBE3 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E9PBE3 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
E9PBE3 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E9PBE3 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E9PBE3 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
E9PBE3 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E9PBE3 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E9PBE3 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E9PBE3 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E9PBE3 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E9PBE3 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E9PBE3 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E9PBE3 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E9PBE3 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E9PBE3 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
E9PBE3 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E9PBE3 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E9PBE3 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E9PBE3 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E9PBE3 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E9PBE3 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E9PBE3 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E9PBE3 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E9PBE3 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E9PBE3 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E9PBE3 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E9PBE3 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E9PBE3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E9PBE3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
E9PBE3 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E9PBE3 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E9PBE3 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E9PBE3 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E9PBE3 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E9PBE3 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E9PBE3 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
E9PBE3 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E9PBE3 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E9PBE3 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E9PBE3 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E9PBE3 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E9PBE3 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E9PBE3 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E9PBE3 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E9PBE3 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E9PBE3 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E9PBE3 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E9PBE3 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E9PBE3 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E9PBE3 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E9PBE3 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E9PBE3 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E9PBE3 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E9PBE3 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E9PBE3 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E9PBE3 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E9PBE3 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E9PBE3 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E9PBE3 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E9PBE3 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E9PBE3 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E9PBE3 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E9PBE3 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E9PBE3 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E9PBE3 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E9PBE3 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E9PBE3 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E9PBE3 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E9PBE3 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E9PBE3 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms