Protein–RNA interactions for Protein: E5RI56

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E5RI56 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E5RI56 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E5RI56 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E5RI56 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E5RI56 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E5RI56 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E5RI56 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E5RI56 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E5RI56 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E5RI56 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
E5RI56 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E5RI56 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
E5RI56 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E5RI56 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
E5RI56 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
E5RI56 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E5RI56 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
E5RI56 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E5RI56 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E5RI56 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E5RI56 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E5RI56 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E5RI56 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E5RI56 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E5RI56 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E5RI56 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E5RI56 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E5RI56 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E5RI56 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E5RI56 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E5RI56 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E5RI56 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E5RI56 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
E5RI56 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
E5RI56 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
E5RI56 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
E5RI56 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
E5RI56 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
E5RI56 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
E5RI56 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
E5RI56 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
E5RI56 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
E5RI56 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
E5RI56 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
E5RI56 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
E5RI56 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
E5RI56 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
E5RI56 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
E5RI56 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
E5RI56 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
E5RI56 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
E5RI56 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
E5RI56 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
E5RI56 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
E5RI56 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
E5RI56 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
E5RI56 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
E5RI56 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
E5RI56 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
E5RI56 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
E5RI56 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
E5RI56 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
E5RI56 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
E5RI56 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
E5RI56 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
E5RI56 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
E5RI56 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
E5RI56 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
E5RI56 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
E5RI56 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
E5RI56 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
E5RI56 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
E5RI56 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
E5RI56 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
E5RI56 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
E5RI56 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
E5RI56 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
E5RI56 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
E5RI56 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
E5RI56 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
E5RI56 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
E5RI56 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
E5RI56 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
E5RI56 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
E5RI56 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
E5RI56 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
E5RI56 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
E5RI56 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
E5RI56 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
E5RI56 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
E5RI56 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
E5RI56 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
E5RI56 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
E5RI56 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
E5RI56 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
E5RI56 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
E5RI56 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
E5RI56 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
E5RI56 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
E5RI56 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms