Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PALM3A6NDB9 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PALM3A6NDB9 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PALM3A6NDB9 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PALM3A6NDB9 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PALM3A6NDB9 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PALM3A6NDB9 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PALM3A6NDB9 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PALM3A6NDB9 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PALM3A6NDB9 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PALM3A6NDB9 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PALM3A6NDB9 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PALM3A6NDB9 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PALM3A6NDB9 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PALM3A6NDB9 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PALM3A6NDB9 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PALM3A6NDB9 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PALM3A6NDB9 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PALM3A6NDB9 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PALM3A6NDB9 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PALM3A6NDB9 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PALM3A6NDB9 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PALM3A6NDB9 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PALM3A6NDB9 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PALM3A6NDB9 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PALM3A6NDB9 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PALM3A6NDB9 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PALM3A6NDB9 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PALM3A6NDB9 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PALM3A6NDB9 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PALM3A6NDB9 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PALM3A6NDB9 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PALM3A6NDB9 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PALM3A6NDB9 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PALM3A6NDB9 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PALM3A6NDB9 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PALM3A6NDB9 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PALM3A6NDB9 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PALM3A6NDB9 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PALM3A6NDB9 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PALM3A6NDB9 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PALM3A6NDB9 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PALM3A6NDB9 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PALM3A6NDB9 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PALM3A6NDB9 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PALM3A6NDB9 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PALM3A6NDB9 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PALM3A6NDB9 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PALM3A6NDB9 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PALM3A6NDB9 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PALM3A6NDB9 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PALM3A6NDB9 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PALM3A6NDB9 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PALM3A6NDB9 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PALM3A6NDB9 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PALM3A6NDB9 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PALM3A6NDB9 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PALM3A6NDB9 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PALM3A6NDB9 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PALM3A6NDB9 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PALM3A6NDB9 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PALM3A6NDB9 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PALM3A6NDB9 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PALM3A6NDB9 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PALM3A6NDB9 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PALM3A6NDB9 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PALM3A6NDB9 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PALM3A6NDB9 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PALM3A6NDB9 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms