Protein–RNA interactions for Protein: A4D161

FAM221A, Protein FAM221A, humanhuman

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM221AA4D161 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM221AA4D161 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM221AA4D161 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM221AA4D161 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM221AA4D161 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM221AA4D161 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM221AA4D161 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM221AA4D161 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM221AA4D161 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM221AA4D161 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM221AA4D161 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM221AA4D161 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM221AA4D161 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM221AA4D161 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM221AA4D161 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM221AA4D161 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM221AA4D161 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM221AA4D161 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM221AA4D161 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms