Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VWA8A3KMH1 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VWA8A3KMH1 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VWA8A3KMH1 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VWA8A3KMH1 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
VWA8A3KMH1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VWA8A3KMH1 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
VWA8A3KMH1 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VWA8A3KMH1 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VWA8A3KMH1 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VWA8A3KMH1 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VWA8A3KMH1 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VWA8A3KMH1 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VWA8A3KMH1 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VWA8A3KMH1 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VWA8A3KMH1 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VWA8A3KMH1 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VWA8A3KMH1 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VWA8A3KMH1 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VWA8A3KMH1 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VWA8A3KMH1 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VWA8A3KMH1 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VWA8A3KMH1 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VWA8A3KMH1 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VWA8A3KMH1 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VWA8A3KMH1 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VWA8A3KMH1 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
VWA8A3KMH1 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VWA8A3KMH1 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VWA8A3KMH1 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VWA8A3KMH1 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VWA8A3KMH1 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VWA8A3KMH1 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VWA8A3KMH1 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VWA8A3KMH1 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
VWA8A3KMH1 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VWA8A3KMH1 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VWA8A3KMH1 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VWA8A3KMH1 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VWA8A3KMH1 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VWA8A3KMH1 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VWA8A3KMH1 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VWA8A3KMH1 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VWA8A3KMH1 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VWA8A3KMH1 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VWA8A3KMH1 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
VWA8A3KMH1 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VWA8A3KMH1 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VWA8A3KMH1 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VWA8A3KMH1 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VWA8A3KMH1 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VWA8A3KMH1 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VWA8A3KMH1 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VWA8A3KMH1 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VWA8A3KMH1 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VWA8A3KMH1 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VWA8A3KMH1 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VWA8A3KMH1 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VWA8A3KMH1 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VWA8A3KMH1 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VWA8A3KMH1 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VWA8A3KMH1 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VWA8A3KMH1 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VWA8A3KMH1 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VWA8A3KMH1 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VWA8A3KMH1 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VWA8A3KMH1 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VWA8A3KMH1 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VWA8A3KMH1 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VWA8A3KMH1 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VWA8A3KMH1 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VWA8A3KMH1 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
VWA8A3KMH1 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VWA8A3KMH1 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VWA8A3KMH1 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VWA8A3KMH1 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VWA8A3KMH1 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VWA8A3KMH1 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VWA8A3KMH1 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VWA8A3KMH1 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VWA8A3KMH1 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VWA8A3KMH1 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VWA8A3KMH1 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VWA8A3KMH1 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VWA8A3KMH1 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VWA8A3KMH1 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VWA8A3KMH1 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VWA8A3KMH1 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VWA8A3KMH1 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VWA8A3KMH1 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VWA8A3KMH1 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
VWA8A3KMH1 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VWA8A3KMH1 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VWA8A3KMH1 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VWA8A3KMH1 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VWA8A3KMH1 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VWA8A3KMH1 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VWA8A3KMH1 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
VWA8A3KMH1 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
VWA8A3KMH1 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms