Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WW87

IGKV2-40, Immunoglobulin kappa variable 2-40, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV2-40A0A087WW87 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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IGKV2-40A0A087WW87 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
IGKV2-40A0A087WW87 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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