Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX13Q9Y5W8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX13Q9Y5W8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX13Q9Y5W8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX13Q9Y5W8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX13Q9Y5W8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX13Q9Y5W8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX13Q9Y5W8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX13Q9Y5W8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX13Q9Y5W8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX13Q9Y5W8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX13Q9Y5W8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX13Q9Y5W8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX13Q9Y5W8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX13Q9Y5W8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX13Q9Y5W8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX13Q9Y5W8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX13Q9Y5W8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX13Q9Y5W8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX13Q9Y5W8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX13Q9Y5W8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX13Q9Y5W8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX13Q9Y5W8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX13Q9Y5W8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX13Q9Y5W8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX13Q9Y5W8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX13Q9Y5W8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX13Q9Y5W8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX13Q9Y5W8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX13Q9Y5W8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX13Q9Y5W8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX13Q9Y5W8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX13Q9Y5W8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX13Q9Y5W8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX13Q9Y5W8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX13Q9Y5W8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX13Q9Y5W8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX13Q9Y5W8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX13Q9Y5W8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX13Q9Y5W8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX13Q9Y5W8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX13Q9Y5W8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX13Q9Y5W8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SNX13Q9Y5W8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX13Q9Y5W8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX13Q9Y5W8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX13Q9Y5W8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX13Q9Y5W8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX13Q9Y5W8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
SNX13Q9Y5W8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SNX13Q9Y5W8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SNX13Q9Y5W8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX13Q9Y5W8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX13Q9Y5W8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX13Q9Y5W8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX13Q9Y5W8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX13Q9Y5W8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX13Q9Y5W8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX13Q9Y5W8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX13Q9Y5W8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX13Q9Y5W8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX13Q9Y5W8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX13Q9Y5W8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX13Q9Y5W8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX13Q9Y5W8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX13Q9Y5W8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX13Q9Y5W8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX13Q9Y5W8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX13Q9Y5W8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX13Q9Y5W8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX13Q9Y5W8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX13Q9Y5W8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX13Q9Y5W8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX13Q9Y5W8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX13Q9Y5W8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX13Q9Y5W8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX13Q9Y5W8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX13Q9Y5W8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX13Q9Y5W8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX13Q9Y5W8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX13Q9Y5W8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX13Q9Y5W8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX13Q9Y5W8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX13Q9Y5W8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX13Q9Y5W8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX13Q9Y5W8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX13Q9Y5W8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX13Q9Y5W8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX13Q9Y5W8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX13Q9Y5W8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX13Q9Y5W8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX13Q9Y5W8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX13Q9Y5W8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX13Q9Y5W8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX13Q9Y5W8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX13Q9Y5W8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX13Q9Y5W8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX13Q9Y5W8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX13Q9Y5W8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX13Q9Y5W8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms