Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T2

AP3M1, AP-3 complex subunit mu-1, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M1Q9Y2T2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AP3M1Q9Y2T2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
AP3M1Q9Y2T2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AP3M1Q9Y2T2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AP3M1Q9Y2T2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AP3M1Q9Y2T2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AP3M1Q9Y2T2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP3M1Q9Y2T2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP3M1Q9Y2T2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP3M1Q9Y2T2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP3M1Q9Y2T2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP3M1Q9Y2T2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP3M1Q9Y2T2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP3M1Q9Y2T2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AP3M1Q9Y2T2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
AP3M1Q9Y2T2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AP3M1Q9Y2T2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AP3M1Q9Y2T2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AP3M1Q9Y2T2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AP3M1Q9Y2T2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AP3M1Q9Y2T2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AP3M1Q9Y2T2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AP3M1Q9Y2T2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AP3M1Q9Y2T2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AP3M1Q9Y2T2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AP3M1Q9Y2T2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AP3M1Q9Y2T2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AP3M1Q9Y2T2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AP3M1Q9Y2T2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AP3M1Q9Y2T2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP3M1Q9Y2T2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP3M1Q9Y2T2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP3M1Q9Y2T2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
AP3M1Q9Y2T2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP3M1Q9Y2T2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP3M1Q9Y2T2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
AP3M1Q9Y2T2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP3M1Q9Y2T2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP3M1Q9Y2T2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP3M1Q9Y2T2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP3M1Q9Y2T2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP3M1Q9Y2T2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP3M1Q9Y2T2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AP3M1Q9Y2T2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
AP3M1Q9Y2T2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
AP3M1Q9Y2T2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
AP3M1Q9Y2T2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP3M1Q9Y2T2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP3M1Q9Y2T2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP3M1Q9Y2T2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP3M1Q9Y2T2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP3M1Q9Y2T2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP3M1Q9Y2T2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP3M1Q9Y2T2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP3M1Q9Y2T2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP3M1Q9Y2T2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP3M1Q9Y2T2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP3M1Q9Y2T2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP3M1Q9Y2T2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP3M1Q9Y2T2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP3M1Q9Y2T2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP3M1Q9Y2T2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP3M1Q9Y2T2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
AP3M1Q9Y2T2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP3M1Q9Y2T2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP3M1Q9Y2T2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP3M1Q9Y2T2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP3M1Q9Y2T2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP3M1Q9Y2T2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP3M1Q9Y2T2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
AP3M1Q9Y2T2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP3M1Q9Y2T2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP3M1Q9Y2T2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP3M1Q9Y2T2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP3M1Q9Y2T2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP3M1Q9Y2T2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
AP3M1Q9Y2T2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP3M1Q9Y2T2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP3M1Q9Y2T2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP3M1Q9Y2T2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP3M1Q9Y2T2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
AP3M1Q9Y2T2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP3M1Q9Y2T2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
AP3M1Q9Y2T2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP3M1Q9Y2T2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP3M1Q9Y2T2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP3M1Q9Y2T2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP3M1Q9Y2T2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP3M1Q9Y2T2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP3M1Q9Y2T2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP3M1Q9Y2T2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP3M1Q9Y2T2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP3M1Q9Y2T2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP3M1Q9Y2T2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP3M1Q9Y2T2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP3M1Q9Y2T2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP3M1Q9Y2T2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP3M1Q9Y2T2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP3M1Q9Y2T2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP3M1Q9Y2T2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms