Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K2

SIK3, Serine/threonine-protein kinase SIK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK3Q9Y2K2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SIK3Q9Y2K2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SIK3Q9Y2K2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SIK3Q9Y2K2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SIK3Q9Y2K2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SIK3Q9Y2K2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SIK3Q9Y2K2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SIK3Q9Y2K2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SIK3Q9Y2K2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SIK3Q9Y2K2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SIK3Q9Y2K2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SIK3Q9Y2K2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SIK3Q9Y2K2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SIK3Q9Y2K2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SIK3Q9Y2K2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SIK3Q9Y2K2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SIK3Q9Y2K2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SIK3Q9Y2K2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SIK3Q9Y2K2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SIK3Q9Y2K2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SIK3Q9Y2K2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SIK3Q9Y2K2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SIK3Q9Y2K2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SIK3Q9Y2K2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SIK3Q9Y2K2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SIK3Q9Y2K2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SIK3Q9Y2K2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SIK3Q9Y2K2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SIK3Q9Y2K2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SIK3Q9Y2K2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SIK3Q9Y2K2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SIK3Q9Y2K2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SIK3Q9Y2K2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SIK3Q9Y2K2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SIK3Q9Y2K2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SIK3Q9Y2K2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SIK3Q9Y2K2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SIK3Q9Y2K2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SIK3Q9Y2K2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SIK3Q9Y2K2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SIK3Q9Y2K2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SIK3Q9Y2K2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SIK3Q9Y2K2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SIK3Q9Y2K2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SIK3Q9Y2K2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SIK3Q9Y2K2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SIK3Q9Y2K2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SIK3Q9Y2K2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SIK3Q9Y2K2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SIK3Q9Y2K2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SIK3Q9Y2K2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SIK3Q9Y2K2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SIK3Q9Y2K2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SIK3Q9Y2K2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SIK3Q9Y2K2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SIK3Q9Y2K2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SIK3Q9Y2K2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SIK3Q9Y2K2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SIK3Q9Y2K2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
SIK3Q9Y2K2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.8
SIK3Q9Y2K2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
SIK3Q9Y2K2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SIK3Q9Y2K2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SIK3Q9Y2K2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SIK3Q9Y2K2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SIK3Q9Y2K2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SIK3Q9Y2K2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SIK3Q9Y2K2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SIK3Q9Y2K2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SIK3Q9Y2K2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SIK3Q9Y2K2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SIK3Q9Y2K2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SIK3Q9Y2K2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SIK3Q9Y2K2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SIK3Q9Y2K2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SIK3Q9Y2K2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SIK3Q9Y2K2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SIK3Q9Y2K2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SIK3Q9Y2K2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SIK3Q9Y2K2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SIK3Q9Y2K2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SIK3Q9Y2K2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SIK3Q9Y2K2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SIK3Q9Y2K2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SIK3Q9Y2K2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SIK3Q9Y2K2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SIK3Q9Y2K2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SIK3Q9Y2K2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SIK3Q9Y2K2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SIK3Q9Y2K2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SIK3Q9Y2K2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SIK3Q9Y2K2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SIK3Q9Y2K2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SIK3Q9Y2K2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SIK3Q9Y2K2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIK3Q9Y2K2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIK3Q9Y2K2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIK3Q9Y2K2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIK3Q9Y2K2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIK3Q9Y2K2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms