Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y234

LIPT1, Lipoyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPT1Q9Y234 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LIPT1Q9Y234 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LIPT1Q9Y234 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LIPT1Q9Y234 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LIPT1Q9Y234 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LIPT1Q9Y234 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LIPT1Q9Y234 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LIPT1Q9Y234 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LIPT1Q9Y234 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LIPT1Q9Y234 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LIPT1Q9Y234 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LIPT1Q9Y234 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
LIPT1Q9Y234 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LIPT1Q9Y234 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LIPT1Q9Y234 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LIPT1Q9Y234 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LIPT1Q9Y234 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LIPT1Q9Y234 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LIPT1Q9Y234 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LIPT1Q9Y234 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LIPT1Q9Y234 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LIPT1Q9Y234 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LIPT1Q9Y234 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LIPT1Q9Y234 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LIPT1Q9Y234 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LIPT1Q9Y234 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LIPT1Q9Y234 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LIPT1Q9Y234 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LIPT1Q9Y234 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LIPT1Q9Y234 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LIPT1Q9Y234 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LIPT1Q9Y234 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LIPT1Q9Y234 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LIPT1Q9Y234 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LIPT1Q9Y234 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LIPT1Q9Y234 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LIPT1Q9Y234 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LIPT1Q9Y234 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LIPT1Q9Y234 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LIPT1Q9Y234 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LIPT1Q9Y234 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LIPT1Q9Y234 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LIPT1Q9Y234 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIPT1Q9Y234 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIPT1Q9Y234 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LIPT1Q9Y234 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIPT1Q9Y234 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LIPT1Q9Y234 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LIPT1Q9Y234 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LIPT1Q9Y234 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LIPT1Q9Y234 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LIPT1Q9Y234 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LIPT1Q9Y234 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LIPT1Q9Y234 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIPT1Q9Y234 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIPT1Q9Y234 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIPT1Q9Y234 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIPT1Q9Y234 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LIPT1Q9Y234 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LIPT1Q9Y234 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LIPT1Q9Y234 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LIPT1Q9Y234 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LIPT1Q9Y234 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LIPT1Q9Y234 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LIPT1Q9Y234 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LIPT1Q9Y234 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LIPT1Q9Y234 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LIPT1Q9Y234 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LIPT1Q9Y234 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LIPT1Q9Y234 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LIPT1Q9Y234 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LIPT1Q9Y234 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LIPT1Q9Y234 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LIPT1Q9Y234 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LIPT1Q9Y234 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LIPT1Q9Y234 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LIPT1Q9Y234 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LIPT1Q9Y234 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LIPT1Q9Y234 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LIPT1Q9Y234 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LIPT1Q9Y234 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
LIPT1Q9Y234 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
LIPT1Q9Y234 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LIPT1Q9Y234 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LIPT1Q9Y234 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LIPT1Q9Y234 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LIPT1Q9Y234 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LIPT1Q9Y234 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LIPT1Q9Y234 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LIPT1Q9Y234 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LIPT1Q9Y234 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LIPT1Q9Y234 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LIPT1Q9Y234 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LIPT1Q9Y234 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LIPT1Q9Y234 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LIPT1Q9Y234 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LIPT1Q9Y234 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LIPT1Q9Y234 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LIPT1Q9Y234 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LIPT1Q9Y234 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms