Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SHOC2Q9UQ13 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SHOC2Q9UQ13 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SHOC2Q9UQ13 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SHOC2Q9UQ13 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SHOC2Q9UQ13 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SHOC2Q9UQ13 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SHOC2Q9UQ13 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SHOC2Q9UQ13 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SHOC2Q9UQ13 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SHOC2Q9UQ13 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SHOC2Q9UQ13 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SHOC2Q9UQ13 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SHOC2Q9UQ13 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SHOC2Q9UQ13 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SHOC2Q9UQ13 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SHOC2Q9UQ13 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SHOC2Q9UQ13 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SHOC2Q9UQ13 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SHOC2Q9UQ13 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SHOC2Q9UQ13 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SHOC2Q9UQ13 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SHOC2Q9UQ13 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SHOC2Q9UQ13 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SHOC2Q9UQ13 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SHOC2Q9UQ13 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SHOC2Q9UQ13 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SHOC2Q9UQ13 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SHOC2Q9UQ13 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SHOC2Q9UQ13 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SHOC2Q9UQ13 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SHOC2Q9UQ13 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SHOC2Q9UQ13 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SHOC2Q9UQ13 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SHOC2Q9UQ13 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SHOC2Q9UQ13 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SHOC2Q9UQ13 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHOC2Q9UQ13 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHOC2Q9UQ13 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SHOC2Q9UQ13 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHOC2Q9UQ13 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHOC2Q9UQ13 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHOC2Q9UQ13 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SHOC2Q9UQ13 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SHOC2Q9UQ13 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SHOC2Q9UQ13 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SHOC2Q9UQ13 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SHOC2Q9UQ13 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SHOC2Q9UQ13 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SHOC2Q9UQ13 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SHOC2Q9UQ13 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SHOC2Q9UQ13 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SHOC2Q9UQ13 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHOC2Q9UQ13 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHOC2Q9UQ13 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHOC2Q9UQ13 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHOC2Q9UQ13 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHOC2Q9UQ13 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHOC2Q9UQ13 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHOC2Q9UQ13 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHOC2Q9UQ13 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHOC2Q9UQ13 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHOC2Q9UQ13 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHOC2Q9UQ13 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHOC2Q9UQ13 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHOC2Q9UQ13 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHOC2Q9UQ13 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHOC2Q9UQ13 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHOC2Q9UQ13 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHOC2Q9UQ13 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHOC2Q9UQ13 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHOC2Q9UQ13 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHOC2Q9UQ13 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHOC2Q9UQ13 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHOC2Q9UQ13 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHOC2Q9UQ13 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHOC2Q9UQ13 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHOC2Q9UQ13 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
SHOC2Q9UQ13 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SHOC2Q9UQ13 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SHOC2Q9UQ13 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SHOC2Q9UQ13 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SHOC2Q9UQ13 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SHOC2Q9UQ13 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SHOC2Q9UQ13 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SHOC2Q9UQ13 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SHOC2Q9UQ13 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SHOC2Q9UQ13 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHOC2Q9UQ13 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHOC2Q9UQ13 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHOC2Q9UQ13 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHOC2Q9UQ13 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHOC2Q9UQ13 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHOC2Q9UQ13 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHOC2Q9UQ13 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHOC2Q9UQ13 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHOC2Q9UQ13 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHOC2Q9UQ13 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHOC2Q9UQ13 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHOC2Q9UQ13 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
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