Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPT9

USP22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP22Q9UPT9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP22Q9UPT9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP22Q9UPT9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP22Q9UPT9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP22Q9UPT9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP22Q9UPT9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP22Q9UPT9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP22Q9UPT9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP22Q9UPT9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP22Q9UPT9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP22Q9UPT9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP22Q9UPT9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP22Q9UPT9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP22Q9UPT9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP22Q9UPT9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP22Q9UPT9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP22Q9UPT9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP22Q9UPT9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
USP22Q9UPT9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP22Q9UPT9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP22Q9UPT9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP22Q9UPT9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP22Q9UPT9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP22Q9UPT9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
USP22Q9UPT9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP22Q9UPT9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP22Q9UPT9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP22Q9UPT9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP22Q9UPT9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP22Q9UPT9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP22Q9UPT9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP22Q9UPT9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP22Q9UPT9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
USP22Q9UPT9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP22Q9UPT9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP22Q9UPT9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP22Q9UPT9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP22Q9UPT9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP22Q9UPT9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP22Q9UPT9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP22Q9UPT9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP22Q9UPT9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP22Q9UPT9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP22Q9UPT9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP22Q9UPT9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP22Q9UPT9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP22Q9UPT9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP22Q9UPT9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP22Q9UPT9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP22Q9UPT9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP22Q9UPT9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP22Q9UPT9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP22Q9UPT9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP22Q9UPT9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP22Q9UPT9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP22Q9UPT9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP22Q9UPT9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP22Q9UPT9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP22Q9UPT9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP22Q9UPT9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP22Q9UPT9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
USP22Q9UPT9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP22Q9UPT9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP22Q9UPT9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP22Q9UPT9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP22Q9UPT9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP22Q9UPT9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP22Q9UPT9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP22Q9UPT9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP22Q9UPT9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP22Q9UPT9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP22Q9UPT9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP22Q9UPT9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP22Q9UPT9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP22Q9UPT9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP22Q9UPT9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP22Q9UPT9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP22Q9UPT9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP22Q9UPT9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
USP22Q9UPT9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
USP22Q9UPT9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
USP22Q9UPT9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP22Q9UPT9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP22Q9UPT9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP22Q9UPT9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP22Q9UPT9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP22Q9UPT9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP22Q9UPT9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP22Q9UPT9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP22Q9UPT9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP22Q9UPT9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP22Q9UPT9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP22Q9UPT9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP22Q9UPT9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP22Q9UPT9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP22Q9UPT9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP22Q9UPT9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
USP22Q9UPT9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP22Q9UPT9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP22Q9UPT9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms