Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMG5Q9UPR3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMG5Q9UPR3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMG5Q9UPR3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMG5Q9UPR3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMG5Q9UPR3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMG5Q9UPR3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMG5Q9UPR3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMG5Q9UPR3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SMG5Q9UPR3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMG5Q9UPR3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMG5Q9UPR3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMG5Q9UPR3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMG5Q9UPR3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMG5Q9UPR3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SMG5Q9UPR3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMG5Q9UPR3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMG5Q9UPR3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMG5Q9UPR3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMG5Q9UPR3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMG5Q9UPR3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SMG5Q9UPR3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMG5Q9UPR3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMG5Q9UPR3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMG5Q9UPR3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SMG5Q9UPR3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMG5Q9UPR3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMG5Q9UPR3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMG5Q9UPR3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMG5Q9UPR3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SMG5Q9UPR3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMG5Q9UPR3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMG5Q9UPR3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMG5Q9UPR3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SMG5Q9UPR3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMG5Q9UPR3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMG5Q9UPR3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMG5Q9UPR3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SMG5Q9UPR3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SMG5Q9UPR3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
SMG5Q9UPR3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SMG5Q9UPR3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SMG5Q9UPR3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
SMG5Q9UPR3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMG5Q9UPR3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SMG5Q9UPR3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMG5Q9UPR3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMG5Q9UPR3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMG5Q9UPR3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMG5Q9UPR3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMG5Q9UPR3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMG5Q9UPR3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMG5Q9UPR3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMG5Q9UPR3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMG5Q9UPR3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMG5Q9UPR3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMG5Q9UPR3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMG5Q9UPR3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMG5Q9UPR3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMG5Q9UPR3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMG5Q9UPR3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMG5Q9UPR3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMG5Q9UPR3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMG5Q9UPR3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMG5Q9UPR3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMG5Q9UPR3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMG5Q9UPR3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMG5Q9UPR3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMG5Q9UPR3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMG5Q9UPR3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMG5Q9UPR3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMG5Q9UPR3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMG5Q9UPR3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMG5Q9UPR3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMG5Q9UPR3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMG5Q9UPR3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMG5Q9UPR3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SMG5Q9UPR3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMG5Q9UPR3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SMG5Q9UPR3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMG5Q9UPR3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMG5Q9UPR3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMG5Q9UPR3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMG5Q9UPR3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMG5Q9UPR3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMG5Q9UPR3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMG5Q9UPR3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMG5Q9UPR3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SMG5Q9UPR3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMG5Q9UPR3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMG5Q9UPR3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SMG5Q9UPR3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMG5Q9UPR3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMG5Q9UPR3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMG5Q9UPR3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMG5Q9UPR3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMG5Q9UPR3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMG5Q9UPR3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SMG5Q9UPR3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMG5Q9UPR3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms