Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN9

TRIM33, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM33, humanhuman

Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM33Q9UPN9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM33Q9UPN9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM33Q9UPN9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM33Q9UPN9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM33Q9UPN9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM33Q9UPN9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM33Q9UPN9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM33Q9UPN9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM33Q9UPN9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM33Q9UPN9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM33Q9UPN9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM33Q9UPN9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM33Q9UPN9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM33Q9UPN9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM33Q9UPN9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM33Q9UPN9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM33Q9UPN9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRIM33Q9UPN9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM33Q9UPN9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM33Q9UPN9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM33Q9UPN9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM33Q9UPN9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM33Q9UPN9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM33Q9UPN9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM33Q9UPN9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM33Q9UPN9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM33Q9UPN9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM33Q9UPN9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM33Q9UPN9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM33Q9UPN9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM33Q9UPN9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM33Q9UPN9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM33Q9UPN9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM33Q9UPN9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM33Q9UPN9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM33Q9UPN9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM33Q9UPN9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM33Q9UPN9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM33Q9UPN9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM33Q9UPN9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM33Q9UPN9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM33Q9UPN9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM33Q9UPN9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM33Q9UPN9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM33Q9UPN9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM33Q9UPN9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM33Q9UPN9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM33Q9UPN9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM33Q9UPN9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM33Q9UPN9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM33Q9UPN9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM33Q9UPN9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM33Q9UPN9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM33Q9UPN9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM33Q9UPN9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM33Q9UPN9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM33Q9UPN9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM33Q9UPN9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM33Q9UPN9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM33Q9UPN9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM33Q9UPN9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM33Q9UPN9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM33Q9UPN9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM33Q9UPN9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM33Q9UPN9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM33Q9UPN9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM33Q9UPN9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM33Q9UPN9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM33Q9UPN9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM33Q9UPN9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM33Q9UPN9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM33Q9UPN9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM33Q9UPN9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM33Q9UPN9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM33Q9UPN9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM33Q9UPN9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM33Q9UPN9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM33Q9UPN9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM33Q9UPN9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM33Q9UPN9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM33Q9UPN9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM33Q9UPN9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM33Q9UPN9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM33Q9UPN9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM33Q9UPN9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRIM33Q9UPN9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRIM33Q9UPN9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM33Q9UPN9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM33Q9UPN9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM33Q9UPN9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM33Q9UPN9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM33Q9UPN9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM33Q9UPN9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM33Q9UPN9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM33Q9UPN9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM33Q9UPN9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM33Q9UPN9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM33Q9UPN9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM33Q9UPN9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM33Q9UPN9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms