Protein–RNA interactions for Protein: Q9UND3

NPIPA1, Nuclear pore complex-interacting protein family member A1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA1Q9UND3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPIPA1Q9UND3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPIPA1Q9UND3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPIPA1Q9UND3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPIPA1Q9UND3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPIPA1Q9UND3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPIPA1Q9UND3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPIPA1Q9UND3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPIPA1Q9UND3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPIPA1Q9UND3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPIPA1Q9UND3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPIPA1Q9UND3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPIPA1Q9UND3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPIPA1Q9UND3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPIPA1Q9UND3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPIPA1Q9UND3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPIPA1Q9UND3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPIPA1Q9UND3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPIPA1Q9UND3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPIPA1Q9UND3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPIPA1Q9UND3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NPIPA1Q9UND3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPIPA1Q9UND3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPIPA1Q9UND3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPIPA1Q9UND3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPIPA1Q9UND3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPIPA1Q9UND3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPIPA1Q9UND3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPIPA1Q9UND3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPIPA1Q9UND3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPIPA1Q9UND3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPIPA1Q9UND3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPIPA1Q9UND3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPIPA1Q9UND3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPIPA1Q9UND3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPIPA1Q9UND3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPIPA1Q9UND3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPIPA1Q9UND3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPIPA1Q9UND3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPIPA1Q9UND3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPIPA1Q9UND3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NPIPA1Q9UND3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPIPA1Q9UND3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPIPA1Q9UND3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPIPA1Q9UND3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPIPA1Q9UND3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPIPA1Q9UND3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NPIPA1Q9UND3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NPIPA1Q9UND3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPIPA1Q9UND3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPIPA1Q9UND3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPIPA1Q9UND3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPIPA1Q9UND3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPIPA1Q9UND3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPIPA1Q9UND3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPIPA1Q9UND3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPIPA1Q9UND3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPIPA1Q9UND3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPIPA1Q9UND3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPIPA1Q9UND3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPIPA1Q9UND3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPIPA1Q9UND3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPIPA1Q9UND3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPIPA1Q9UND3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPIPA1Q9UND3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPIPA1Q9UND3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPIPA1Q9UND3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPIPA1Q9UND3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPIPA1Q9UND3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NPIPA1Q9UND3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPIPA1Q9UND3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPIPA1Q9UND3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPIPA1Q9UND3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPIPA1Q9UND3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NPIPA1Q9UND3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPIPA1Q9UND3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPIPA1Q9UND3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPIPA1Q9UND3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NPIPA1Q9UND3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPIPA1Q9UND3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPIPA1Q9UND3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPIPA1Q9UND3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPIPA1Q9UND3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NPIPA1Q9UND3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPIPA1Q9UND3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPIPA1Q9UND3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPIPA1Q9UND3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPIPA1Q9UND3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPIPA1Q9UND3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPIPA1Q9UND3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NPIPA1Q9UND3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPIPA1Q9UND3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPIPA1Q9UND3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPIPA1Q9UND3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPIPA1Q9UND3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPIPA1Q9UND3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NPIPA1Q9UND3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPIPA1Q9UND3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NPIPA1Q9UND3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NPIPA1Q9UND3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms