Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD9

ZNF608, Zinc finger protein 608, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF608Q9ULD9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC41.46■■■■■ 4.23
ZNF608Q9ULD9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
ZNF608Q9ULD9 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC41.46■■■■■ 4.23
ZNF608Q9ULD9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC41.45■■■■■ 4.23
ZNF608Q9ULD9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
ZNF608Q9ULD9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC41.45■■■■■ 4.23
ZNF608Q9ULD9 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC41.44■■■■■ 4.23
ZNF608Q9ULD9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
ZNF608Q9ULD9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
ZNF608Q9ULD9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC41.43■■■■■ 4.22
ZNF608Q9ULD9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
ZNF608Q9ULD9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC41.43■■■■■ 4.22
ZNF608Q9ULD9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC41.43■■■■■ 4.22
ZNF608Q9ULD9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
ZNF608Q9ULD9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
ZNF608Q9ULD9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC41.42■■■■■ 4.22
ZNF608Q9ULD9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC41.42■■■■■ 4.22
ZNF608Q9ULD9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
ZNF608Q9ULD9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
ZNF608Q9ULD9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC41.41■■■■■ 4.22
ZNF608Q9ULD9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC41.4■■■■■ 4.22
ZNF608Q9ULD9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
ZNF608Q9ULD9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
ZNF608Q9ULD9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC41.39■■■■■ 4.22
ZNF608Q9ULD9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
ZNF608Q9ULD9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
ZNF608Q9ULD9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC41.38■■■■■ 4.21
ZNF608Q9ULD9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
ZNF608Q9ULD9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC41.37■■■■■ 4.21
ZNF608Q9ULD9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC41.37■■■■■ 4.21
ZNF608Q9ULD9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC41.37■■■■■ 4.21
ZNF608Q9ULD9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
ZNF608Q9ULD9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
ZNF608Q9ULD9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.36■■■■■ 4.21
ZNF608Q9ULD9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
ZNF608Q9ULD9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
ZNF608Q9ULD9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
ZNF608Q9ULD9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC41.33■■■■■ 4.21
ZNF608Q9ULD9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.21
ZNF608Q9ULD9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
ZNF608Q9ULD9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
ZNF608Q9ULD9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC41.31■■■■■ 4.2
ZNF608Q9ULD9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
ZNF608Q9ULD9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
ZNF608Q9ULD9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC41.3■■■■■ 4.2
ZNF608Q9ULD9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC41.3■■■■■ 4.2
ZNF608Q9ULD9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC41.3■■■■■ 4.2
ZNF608Q9ULD9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
ZNF608Q9ULD9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC41.3■■■■■ 4.2
ZNF608Q9ULD9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.3■■■■■ 4.2
ZNF608Q9ULD9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC41.29■■■■■ 4.2
ZNF608Q9ULD9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
ZNF608Q9ULD9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
ZNF608Q9ULD9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.28■■■■■ 4.2
ZNF608Q9ULD9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC41.28■■■■■ 4.2
ZNF608Q9ULD9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.28■■■■■ 4.2
ZNF608Q9ULD9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC41.27■■■■■ 4.2
ZNF608Q9ULD9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC41.27■■■■■ 4.2
ZNF608Q9ULD9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
ZNF608Q9ULD9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC41.25■■■■■ 4.19
ZNF608Q9ULD9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC41.25■■■■■ 4.19
ZNF608Q9ULD9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC41.25■■■■■ 4.19
ZNF608Q9ULD9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
ZNF608Q9ULD9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC41.24■■■■■ 4.19
ZNF608Q9ULD9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
ZNF608Q9ULD9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC41.24■■■■■ 4.19
ZNF608Q9ULD9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC41.24■■■■■ 4.19
ZNF608Q9ULD9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
ZNF608Q9ULD9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC41.23■■■■■ 4.19
ZNF608Q9ULD9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC41.23■■■■■ 4.19
ZNF608Q9ULD9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC41.23■■■■■ 4.19
ZNF608Q9ULD9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
ZNF608Q9ULD9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
ZNF608Q9ULD9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC41.22■■■■■ 4.19
ZNF608Q9ULD9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC41.22■■■■■ 4.19
ZNF608Q9ULD9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
ZNF608Q9ULD9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
ZNF608Q9ULD9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC41.21■■■■■ 4.19
ZNF608Q9ULD9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC41.21■■■■■ 4.19
ZNF608Q9ULD9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
ZNF608Q9ULD9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC41.2■■■■■ 4.19
ZNF608Q9ULD9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC41.2■■■■■ 4.19
ZNF608Q9ULD9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
ZNF608Q9ULD9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC41.19■■■■■ 4.18
ZNF608Q9ULD9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
ZNF608Q9ULD9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC41.19■■■■■ 4.18
ZNF608Q9ULD9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
ZNF608Q9ULD9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC41.19■■■■■ 4.18
ZNF608Q9ULD9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC41.18■■■■■ 4.18
ZNF608Q9ULD9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC41.18■■■■■ 4.18
ZNF608Q9ULD9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC41.18■■■■■ 4.18
ZNF608Q9ULD9 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
ZNF608Q9ULD9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
ZNF608Q9ULD9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC41.17■■■■■ 4.18
ZNF608Q9ULD9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
ZNF608Q9ULD9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
ZNF608Q9ULD9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC41.16■■■■■ 4.18
ZNF608Q9ULD9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
ZNF608Q9ULD9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC41.15■■■■■ 4.18
ZNF608Q9ULD9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC41.15■■■■■ 4.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms