Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RIMS3Q9UJD0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RIMS3Q9UJD0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RIMS3Q9UJD0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RIMS3Q9UJD0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RIMS3Q9UJD0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RIMS3Q9UJD0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RIMS3Q9UJD0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RIMS3Q9UJD0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RIMS3Q9UJD0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RIMS3Q9UJD0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RIMS3Q9UJD0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RIMS3Q9UJD0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RIMS3Q9UJD0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RIMS3Q9UJD0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RIMS3Q9UJD0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RIMS3Q9UJD0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RIMS3Q9UJD0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RIMS3Q9UJD0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RIMS3Q9UJD0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RIMS3Q9UJD0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RIMS3Q9UJD0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RIMS3Q9UJD0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RIMS3Q9UJD0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RIMS3Q9UJD0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RIMS3Q9UJD0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RIMS3Q9UJD0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RIMS3Q9UJD0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RIMS3Q9UJD0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RIMS3Q9UJD0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RIMS3Q9UJD0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RIMS3Q9UJD0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RIMS3Q9UJD0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RIMS3Q9UJD0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RIMS3Q9UJD0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RIMS3Q9UJD0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RIMS3Q9UJD0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RIMS3Q9UJD0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RIMS3Q9UJD0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIMS3Q9UJD0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIMS3Q9UJD0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIMS3Q9UJD0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIMS3Q9UJD0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIMS3Q9UJD0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIMS3Q9UJD0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIMS3Q9UJD0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIMS3Q9UJD0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIMS3Q9UJD0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIMS3Q9UJD0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIMS3Q9UJD0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIMS3Q9UJD0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RIMS3Q9UJD0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIMS3Q9UJD0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIMS3Q9UJD0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIMS3Q9UJD0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIMS3Q9UJD0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIMS3Q9UJD0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIMS3Q9UJD0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIMS3Q9UJD0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
RIMS3Q9UJD0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
RIMS3Q9UJD0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RIMS3Q9UJD0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RIMS3Q9UJD0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RIMS3Q9UJD0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RIMS3Q9UJD0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RIMS3Q9UJD0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RIMS3Q9UJD0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RIMS3Q9UJD0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RIMS3Q9UJD0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIMS3Q9UJD0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIMS3Q9UJD0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIMS3Q9UJD0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIMS3Q9UJD0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIMS3Q9UJD0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RIMS3Q9UJD0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIMS3Q9UJD0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIMS3Q9UJD0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIMS3Q9UJD0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIMS3Q9UJD0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIMS3Q9UJD0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIMS3Q9UJD0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIMS3Q9UJD0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIMS3Q9UJD0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIMS3Q9UJD0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIMS3Q9UJD0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIMS3Q9UJD0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIMS3Q9UJD0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIMS3Q9UJD0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIMS3Q9UJD0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIMS3Q9UJD0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIMS3Q9UJD0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIMS3Q9UJD0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIMS3Q9UJD0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIMS3Q9UJD0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIMS3Q9UJD0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIMS3Q9UJD0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIMS3Q9UJD0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIMS3Q9UJD0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RIMS3Q9UJD0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIMS3Q9UJD0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms