Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEFF2Q9UIK5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEFF2Q9UIK5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEFF2Q9UIK5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEFF2Q9UIK5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEFF2Q9UIK5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEFF2Q9UIK5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEFF2Q9UIK5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEFF2Q9UIK5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEFF2Q9UIK5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEFF2Q9UIK5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEFF2Q9UIK5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEFF2Q9UIK5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEFF2Q9UIK5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEFF2Q9UIK5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEFF2Q9UIK5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEFF2Q9UIK5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEFF2Q9UIK5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEFF2Q9UIK5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEFF2Q9UIK5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEFF2Q9UIK5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEFF2Q9UIK5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEFF2Q9UIK5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEFF2Q9UIK5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEFF2Q9UIK5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEFF2Q9UIK5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEFF2Q9UIK5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEFF2Q9UIK5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEFF2Q9UIK5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEFF2Q9UIK5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEFF2Q9UIK5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEFF2Q9UIK5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEFF2Q9UIK5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEFF2Q9UIK5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEFF2Q9UIK5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEFF2Q9UIK5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEFF2Q9UIK5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEFF2Q9UIK5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEFF2Q9UIK5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEFF2Q9UIK5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEFF2Q9UIK5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEFF2Q9UIK5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEFF2Q9UIK5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEFF2Q9UIK5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEFF2Q9UIK5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEFF2Q9UIK5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEFF2Q9UIK5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEFF2Q9UIK5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEFF2Q9UIK5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEFF2Q9UIK5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEFF2Q9UIK5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEFF2Q9UIK5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEFF2Q9UIK5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEFF2Q9UIK5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEFF2Q9UIK5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEFF2Q9UIK5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEFF2Q9UIK5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEFF2Q9UIK5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEFF2Q9UIK5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEFF2Q9UIK5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEFF2Q9UIK5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEFF2Q9UIK5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEFF2Q9UIK5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEFF2Q9UIK5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEFF2Q9UIK5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEFF2Q9UIK5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEFF2Q9UIK5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEFF2Q9UIK5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEFF2Q9UIK5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEFF2Q9UIK5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEFF2Q9UIK5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEFF2Q9UIK5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEFF2Q9UIK5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEFF2Q9UIK5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEFF2Q9UIK5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEFF2Q9UIK5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEFF2Q9UIK5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEFF2Q9UIK5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEFF2Q9UIK5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEFF2Q9UIK5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEFF2Q9UIK5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEFF2Q9UIK5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEFF2Q9UIK5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEFF2Q9UIK5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEFF2Q9UIK5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEFF2Q9UIK5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEFF2Q9UIK5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEFF2Q9UIK5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEFF2Q9UIK5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEFF2Q9UIK5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEFF2Q9UIK5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEFF2Q9UIK5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEFF2Q9UIK5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEFF2Q9UIK5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEFF2Q9UIK5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEFF2Q9UIK5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEFF2Q9UIK5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEFF2Q9UIK5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEFF2Q9UIK5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEFF2Q9UIK5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms