Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHI6

DDX20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX20Q9UHI6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
DDX20Q9UHI6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DDX20Q9UHI6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DDX20Q9UHI6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DDX20Q9UHI6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DDX20Q9UHI6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DDX20Q9UHI6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DDX20Q9UHI6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DDX20Q9UHI6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
DDX20Q9UHI6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DDX20Q9UHI6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DDX20Q9UHI6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.04
DDX20Q9UHI6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DDX20Q9UHI6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DDX20Q9UHI6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DDX20Q9UHI6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DDX20Q9UHI6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DDX20Q9UHI6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DDX20Q9UHI6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DDX20Q9UHI6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DDX20Q9UHI6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DDX20Q9UHI6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DDX20Q9UHI6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DDX20Q9UHI6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
DDX20Q9UHI6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
DDX20Q9UHI6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DDX20Q9UHI6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DDX20Q9UHI6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDX20Q9UHI6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DDX20Q9UHI6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DDX20Q9UHI6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DDX20Q9UHI6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DDX20Q9UHI6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DDX20Q9UHI6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
DDX20Q9UHI6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
DDX20Q9UHI6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DDX20Q9UHI6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DDX20Q9UHI6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
DDX20Q9UHI6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DDX20Q9UHI6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DDX20Q9UHI6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DDX20Q9UHI6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DDX20Q9UHI6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DDX20Q9UHI6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX20Q9UHI6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX20Q9UHI6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX20Q9UHI6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX20Q9UHI6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDX20Q9UHI6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDX20Q9UHI6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
DDX20Q9UHI6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDX20Q9UHI6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDX20Q9UHI6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDX20Q9UHI6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDX20Q9UHI6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDX20Q9UHI6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDX20Q9UHI6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDX20Q9UHI6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDX20Q9UHI6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDX20Q9UHI6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDX20Q9UHI6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
DDX20Q9UHI6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
DDX20Q9UHI6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DDX20Q9UHI6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
DDX20Q9UHI6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
DDX20Q9UHI6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDX20Q9UHI6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDX20Q9UHI6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDX20Q9UHI6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDX20Q9UHI6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDX20Q9UHI6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDX20Q9UHI6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDX20Q9UHI6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDX20Q9UHI6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDX20Q9UHI6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDX20Q9UHI6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDX20Q9UHI6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDX20Q9UHI6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
DDX20Q9UHI6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DDX20Q9UHI6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DDX20Q9UHI6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DDX20Q9UHI6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DDX20Q9UHI6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
DDX20Q9UHI6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DDX20Q9UHI6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DDX20Q9UHI6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DDX20Q9UHI6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDX20Q9UHI6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDX20Q9UHI6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
DDX20Q9UHI6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
DDX20Q9UHI6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDX20Q9UHI6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DDX20Q9UHI6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
DDX20Q9UHI6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DDX20Q9UHI6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
DDX20Q9UHI6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DDX20Q9UHI6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
DDX20Q9UHI6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DDX20Q9UHI6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
DDX20Q9UHI6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms