Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH64

CDKN2A-AS1, Susceptibility protein NSG-x, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2A-AS1Q9UH64 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDKN2A-AS1Q9UH64 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDKN2A-AS1Q9UH64 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDKN2A-AS1Q9UH64 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDKN2A-AS1Q9UH64 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDKN2A-AS1Q9UH64 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CDKN2A-AS1Q9UH64 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDKN2A-AS1Q9UH64 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDKN2A-AS1Q9UH64 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDKN2A-AS1Q9UH64 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDKN2A-AS1Q9UH64 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDKN2A-AS1Q9UH64 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDKN2A-AS1Q9UH64 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDKN2A-AS1Q9UH64 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDKN2A-AS1Q9UH64 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CDKN2A-AS1Q9UH64 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CDKN2A-AS1Q9UH64 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDKN2A-AS1Q9UH64 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDKN2A-AS1Q9UH64 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDKN2A-AS1Q9UH64 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDKN2A-AS1Q9UH64 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDKN2A-AS1Q9UH64 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDKN2A-AS1Q9UH64 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDKN2A-AS1Q9UH64 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDKN2A-AS1Q9UH64 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKN2A-AS1Q9UH64 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKN2A-AS1Q9UH64 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKN2A-AS1Q9UH64 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKN2A-AS1Q9UH64 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKN2A-AS1Q9UH64 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKN2A-AS1Q9UH64 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKN2A-AS1Q9UH64 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKN2A-AS1Q9UH64 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDKN2A-AS1Q9UH64 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDKN2A-AS1Q9UH64 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDKN2A-AS1Q9UH64 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDKN2A-AS1Q9UH64 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDKN2A-AS1Q9UH64 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDKN2A-AS1Q9UH64 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDKN2A-AS1Q9UH64 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDKN2A-AS1Q9UH64 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDKN2A-AS1Q9UH64 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CDKN2A-AS1Q9UH64 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDKN2A-AS1Q9UH64 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDKN2A-AS1Q9UH64 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDKN2A-AS1Q9UH64 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDKN2A-AS1Q9UH64 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDKN2A-AS1Q9UH64 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDKN2A-AS1Q9UH64 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDKN2A-AS1Q9UH64 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDKN2A-AS1Q9UH64 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDKN2A-AS1Q9UH64 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDKN2A-AS1Q9UH64 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDKN2A-AS1Q9UH64 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDKN2A-AS1Q9UH64 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDKN2A-AS1Q9UH64 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDKN2A-AS1Q9UH64 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDKN2A-AS1Q9UH64 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDKN2A-AS1Q9UH64 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDKN2A-AS1Q9UH64 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDKN2A-AS1Q9UH64 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDKN2A-AS1Q9UH64 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDKN2A-AS1Q9UH64 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDKN2A-AS1Q9UH64 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDKN2A-AS1Q9UH64 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDKN2A-AS1Q9UH64 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDKN2A-AS1Q9UH64 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDKN2A-AS1Q9UH64 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDKN2A-AS1Q9UH64 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDKN2A-AS1Q9UH64 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDKN2A-AS1Q9UH64 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDKN2A-AS1Q9UH64 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDKN2A-AS1Q9UH64 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDKN2A-AS1Q9UH64 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDKN2A-AS1Q9UH64 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDKN2A-AS1Q9UH64 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDKN2A-AS1Q9UH64 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDKN2A-AS1Q9UH64 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDKN2A-AS1Q9UH64 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDKN2A-AS1Q9UH64 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDKN2A-AS1Q9UH64 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDKN2A-AS1Q9UH64 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDKN2A-AS1Q9UH64 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDKN2A-AS1Q9UH64 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKN2A-AS1Q9UH64 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKN2A-AS1Q9UH64 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKN2A-AS1Q9UH64 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKN2A-AS1Q9UH64 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKN2A-AS1Q9UH64 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKN2A-AS1Q9UH64 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKN2A-AS1Q9UH64 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKN2A-AS1Q9UH64 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKN2A-AS1Q9UH64 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKN2A-AS1Q9UH64 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKN2A-AS1Q9UH64 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKN2A-AS1Q9UH64 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKN2A-AS1Q9UH64 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKN2A-AS1Q9UH64 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms