Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTNNAL1Q9UBT7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTNNAL1Q9UBT7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTNNAL1Q9UBT7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTNNAL1Q9UBT7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTNNAL1Q9UBT7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTNNAL1Q9UBT7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTNNAL1Q9UBT7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CTNNAL1Q9UBT7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CTNNAL1Q9UBT7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTNNAL1Q9UBT7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTNNAL1Q9UBT7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTNNAL1Q9UBT7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTNNAL1Q9UBT7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTNNAL1Q9UBT7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTNNAL1Q9UBT7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTNNAL1Q9UBT7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTNNAL1Q9UBT7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTNNAL1Q9UBT7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTNNAL1Q9UBT7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTNNAL1Q9UBT7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTNNAL1Q9UBT7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTNNAL1Q9UBT7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTNNAL1Q9UBT7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTNNAL1Q9UBT7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CTNNAL1Q9UBT7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTNNAL1Q9UBT7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTNNAL1Q9UBT7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTNNAL1Q9UBT7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTNNAL1Q9UBT7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTNNAL1Q9UBT7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTNNAL1Q9UBT7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CTNNAL1Q9UBT7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTNNAL1Q9UBT7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTNNAL1Q9UBT7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTNNAL1Q9UBT7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTNNAL1Q9UBT7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTNNAL1Q9UBT7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTNNAL1Q9UBT7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTNNAL1Q9UBT7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTNNAL1Q9UBT7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTNNAL1Q9UBT7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTNNAL1Q9UBT7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTNNAL1Q9UBT7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTNNAL1Q9UBT7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CTNNAL1Q9UBT7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTNNAL1Q9UBT7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTNNAL1Q9UBT7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTNNAL1Q9UBT7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CTNNAL1Q9UBT7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTNNAL1Q9UBT7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTNNAL1Q9UBT7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTNNAL1Q9UBT7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CTNNAL1Q9UBT7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTNNAL1Q9UBT7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTNNAL1Q9UBT7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTNNAL1Q9UBT7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTNNAL1Q9UBT7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTNNAL1Q9UBT7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTNNAL1Q9UBT7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTNNAL1Q9UBT7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTNNAL1Q9UBT7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTNNAL1Q9UBT7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTNNAL1Q9UBT7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTNNAL1Q9UBT7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTNNAL1Q9UBT7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTNNAL1Q9UBT7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTNNAL1Q9UBT7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTNNAL1Q9UBT7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTNNAL1Q9UBT7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CTNNAL1Q9UBT7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTNNAL1Q9UBT7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTNNAL1Q9UBT7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTNNAL1Q9UBT7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTNNAL1Q9UBT7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTNNAL1Q9UBT7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTNNAL1Q9UBT7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTNNAL1Q9UBT7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTNNAL1Q9UBT7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTNNAL1Q9UBT7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTNNAL1Q9UBT7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTNNAL1Q9UBT7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTNNAL1Q9UBT7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTNNAL1Q9UBT7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTNNAL1Q9UBT7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTNNAL1Q9UBT7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTNNAL1Q9UBT7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTNNAL1Q9UBT7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTNNAL1Q9UBT7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTNNAL1Q9UBT7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTNNAL1Q9UBT7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTNNAL1Q9UBT7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.4 ms