Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBJ2

ABCD2, ATP-binding cassette sub-family D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD2Q9UBJ2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCD2Q9UBJ2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCD2Q9UBJ2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCD2Q9UBJ2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCD2Q9UBJ2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCD2Q9UBJ2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCD2Q9UBJ2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCD2Q9UBJ2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCD2Q9UBJ2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCD2Q9UBJ2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCD2Q9UBJ2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCD2Q9UBJ2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCD2Q9UBJ2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCD2Q9UBJ2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCD2Q9UBJ2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCD2Q9UBJ2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCD2Q9UBJ2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCD2Q9UBJ2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ABCD2Q9UBJ2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ABCD2Q9UBJ2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ABCD2Q9UBJ2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ABCD2Q9UBJ2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ABCD2Q9UBJ2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ABCD2Q9UBJ2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ABCD2Q9UBJ2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ABCD2Q9UBJ2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCD2Q9UBJ2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCD2Q9UBJ2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCD2Q9UBJ2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCD2Q9UBJ2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCD2Q9UBJ2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCD2Q9UBJ2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCD2Q9UBJ2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCD2Q9UBJ2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCD2Q9UBJ2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCD2Q9UBJ2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCD2Q9UBJ2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCD2Q9UBJ2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCD2Q9UBJ2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCD2Q9UBJ2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCD2Q9UBJ2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCD2Q9UBJ2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCD2Q9UBJ2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCD2Q9UBJ2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCD2Q9UBJ2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCD2Q9UBJ2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCD2Q9UBJ2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCD2Q9UBJ2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCD2Q9UBJ2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCD2Q9UBJ2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCD2Q9UBJ2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCD2Q9UBJ2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCD2Q9UBJ2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCD2Q9UBJ2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCD2Q9UBJ2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCD2Q9UBJ2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCD2Q9UBJ2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCD2Q9UBJ2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCD2Q9UBJ2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCD2Q9UBJ2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCD2Q9UBJ2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCD2Q9UBJ2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCD2Q9UBJ2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCD2Q9UBJ2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCD2Q9UBJ2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABCD2Q9UBJ2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABCD2Q9UBJ2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABCD2Q9UBJ2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABCD2Q9UBJ2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABCD2Q9UBJ2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABCD2Q9UBJ2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABCD2Q9UBJ2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABCD2Q9UBJ2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABCD2Q9UBJ2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCD2Q9UBJ2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCD2Q9UBJ2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCD2Q9UBJ2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCD2Q9UBJ2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCD2Q9UBJ2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCD2Q9UBJ2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCD2Q9UBJ2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCD2Q9UBJ2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCD2Q9UBJ2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCD2Q9UBJ2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCD2Q9UBJ2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCD2Q9UBJ2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCD2Q9UBJ2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCD2Q9UBJ2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCD2Q9UBJ2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCD2Q9UBJ2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCD2Q9UBJ2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCD2Q9UBJ2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCD2Q9UBJ2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCD2Q9UBJ2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCD2Q9UBJ2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCD2Q9UBJ2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCD2Q9UBJ2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCD2Q9UBJ2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ABCD2Q9UBJ2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ABCD2Q9UBJ2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms