Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2W1

PSMC3IP, Homologous-pairing protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC3IPQ9P2W1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMC3IPQ9P2W1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMC3IPQ9P2W1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMC3IPQ9P2W1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMC3IPQ9P2W1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMC3IPQ9P2W1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMC3IPQ9P2W1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMC3IPQ9P2W1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMC3IPQ9P2W1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMC3IPQ9P2W1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMC3IPQ9P2W1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMC3IPQ9P2W1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMC3IPQ9P2W1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMC3IPQ9P2W1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMC3IPQ9P2W1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMC3IPQ9P2W1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMC3IPQ9P2W1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMC3IPQ9P2W1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMC3IPQ9P2W1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMC3IPQ9P2W1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMC3IPQ9P2W1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMC3IPQ9P2W1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMC3IPQ9P2W1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMC3IPQ9P2W1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMC3IPQ9P2W1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMC3IPQ9P2W1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMC3IPQ9P2W1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMC3IPQ9P2W1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMC3IPQ9P2W1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMC3IPQ9P2W1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMC3IPQ9P2W1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMC3IPQ9P2W1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMC3IPQ9P2W1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMC3IPQ9P2W1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMC3IPQ9P2W1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMC3IPQ9P2W1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMC3IPQ9P2W1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMC3IPQ9P2W1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMC3IPQ9P2W1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PSMC3IPQ9P2W1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
PSMC3IPQ9P2W1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSMC3IPQ9P2W1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PSMC3IPQ9P2W1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSMC3IPQ9P2W1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSMC3IPQ9P2W1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSMC3IPQ9P2W1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSMC3IPQ9P2W1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMC3IPQ9P2W1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMC3IPQ9P2W1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMC3IPQ9P2W1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMC3IPQ9P2W1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMC3IPQ9P2W1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMC3IPQ9P2W1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMC3IPQ9P2W1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMC3IPQ9P2W1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMC3IPQ9P2W1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMC3IPQ9P2W1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMC3IPQ9P2W1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMC3IPQ9P2W1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMC3IPQ9P2W1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMC3IPQ9P2W1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMC3IPQ9P2W1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMC3IPQ9P2W1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMC3IPQ9P2W1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMC3IPQ9P2W1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMC3IPQ9P2W1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMC3IPQ9P2W1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMC3IPQ9P2W1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMC3IPQ9P2W1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMC3IPQ9P2W1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMC3IPQ9P2W1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMC3IPQ9P2W1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSMC3IPQ9P2W1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSMC3IPQ9P2W1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSMC3IPQ9P2W1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSMC3IPQ9P2W1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSMC3IPQ9P2W1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PSMC3IPQ9P2W1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PSMC3IPQ9P2W1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMC3IPQ9P2W1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMC3IPQ9P2W1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMC3IPQ9P2W1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMC3IPQ9P2W1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMC3IPQ9P2W1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMC3IPQ9P2W1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMC3IPQ9P2W1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMC3IPQ9P2W1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMC3IPQ9P2W1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMC3IPQ9P2W1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMC3IPQ9P2W1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMC3IPQ9P2W1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMC3IPQ9P2W1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMC3IPQ9P2W1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMC3IPQ9P2W1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMC3IPQ9P2W1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMC3IPQ9P2W1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMC3IPQ9P2W1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMC3IPQ9P2W1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMC3IPQ9P2W1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMC3IPQ9P2W1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.7 ms