Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B4

CTTNBP2NL, CTTNBP2 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2NLQ9P2B4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CTTNBP2NLQ9P2B4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTTNBP2NLQ9P2B4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTTNBP2NLQ9P2B4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTTNBP2NLQ9P2B4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CTTNBP2NLQ9P2B4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTTNBP2NLQ9P2B4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTTNBP2NLQ9P2B4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTTNBP2NLQ9P2B4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTTNBP2NLQ9P2B4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTTNBP2NLQ9P2B4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTTNBP2NLQ9P2B4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTTNBP2NLQ9P2B4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTTNBP2NLQ9P2B4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTTNBP2NLQ9P2B4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTTNBP2NLQ9P2B4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTTNBP2NLQ9P2B4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTTNBP2NLQ9P2B4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTTNBP2NLQ9P2B4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTTNBP2NLQ9P2B4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CTTNBP2NLQ9P2B4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTTNBP2NLQ9P2B4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTTNBP2NLQ9P2B4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTTNBP2NLQ9P2B4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTTNBP2NLQ9P2B4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTTNBP2NLQ9P2B4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTTNBP2NLQ9P2B4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTTNBP2NLQ9P2B4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTTNBP2NLQ9P2B4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTTNBP2NLQ9P2B4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTTNBP2NLQ9P2B4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTTNBP2NLQ9P2B4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTTNBP2NLQ9P2B4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTTNBP2NLQ9P2B4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTTNBP2NLQ9P2B4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTTNBP2NLQ9P2B4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTTNBP2NLQ9P2B4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTTNBP2NLQ9P2B4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTTNBP2NLQ9P2B4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTTNBP2NLQ9P2B4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTTNBP2NLQ9P2B4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTTNBP2NLQ9P2B4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CTTNBP2NLQ9P2B4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTTNBP2NLQ9P2B4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTTNBP2NLQ9P2B4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTTNBP2NLQ9P2B4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CTTNBP2NLQ9P2B4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTTNBP2NLQ9P2B4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CTTNBP2NLQ9P2B4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTTNBP2NLQ9P2B4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CTTNBP2NLQ9P2B4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTTNBP2NLQ9P2B4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTTNBP2NLQ9P2B4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTTNBP2NLQ9P2B4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTTNBP2NLQ9P2B4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTTNBP2NLQ9P2B4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTTNBP2NLQ9P2B4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTTNBP2NLQ9P2B4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTTNBP2NLQ9P2B4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTTNBP2NLQ9P2B4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTTNBP2NLQ9P2B4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CTTNBP2NLQ9P2B4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CTTNBP2NLQ9P2B4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CTTNBP2NLQ9P2B4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CTTNBP2NLQ9P2B4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CTTNBP2NLQ9P2B4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CTTNBP2NLQ9P2B4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CTTNBP2NLQ9P2B4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CTTNBP2NLQ9P2B4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CTTNBP2NLQ9P2B4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CTTNBP2NLQ9P2B4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CTTNBP2NLQ9P2B4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CTTNBP2NLQ9P2B4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CTTNBP2NLQ9P2B4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CTTNBP2NLQ9P2B4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CTTNBP2NLQ9P2B4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CTTNBP2NLQ9P2B4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CTTNBP2NLQ9P2B4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CTTNBP2NLQ9P2B4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CTTNBP2NLQ9P2B4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTTNBP2NLQ9P2B4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTTNBP2NLQ9P2B4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CTTNBP2NLQ9P2B4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CTTNBP2NLQ9P2B4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CTTNBP2NLQ9P2B4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CTTNBP2NLQ9P2B4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms