Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L9

PKD2L1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2L1Q9P0L9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PKD2L1Q9P0L9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PKD2L1Q9P0L9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PKD2L1Q9P0L9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PKD2L1Q9P0L9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PKD2L1Q9P0L9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PKD2L1Q9P0L9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PKD2L1Q9P0L9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PKD2L1Q9P0L9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PKD2L1Q9P0L9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PKD2L1Q9P0L9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PKD2L1Q9P0L9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PKD2L1Q9P0L9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PKD2L1Q9P0L9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PKD2L1Q9P0L9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PKD2L1Q9P0L9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PKD2L1Q9P0L9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PKD2L1Q9P0L9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PKD2L1Q9P0L9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PKD2L1Q9P0L9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PKD2L1Q9P0L9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PKD2L1Q9P0L9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PKD2L1Q9P0L9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PKD2L1Q9P0L9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PKD2L1Q9P0L9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PKD2L1Q9P0L9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PKD2L1Q9P0L9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2
PKD2L1Q9P0L9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2
PKD2L1Q9P0L9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PKD2L1Q9P0L9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PKD2L1Q9P0L9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PKD2L1Q9P0L9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PKD2L1Q9P0L9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PKD2L1Q9P0L9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PKD2L1Q9P0L9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PKD2L1Q9P0L9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PKD2L1Q9P0L9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PKD2L1Q9P0L9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PKD2L1Q9P0L9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PKD2L1Q9P0L9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PKD2L1Q9P0L9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PKD2L1Q9P0L9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PKD2L1Q9P0L9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PKD2L1Q9P0L9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PKD2L1Q9P0L9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PKD2L1Q9P0L9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PKD2L1Q9P0L9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
PKD2L1Q9P0L9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PKD2L1Q9P0L9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PKD2L1Q9P0L9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PKD2L1Q9P0L9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PKD2L1Q9P0L9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PKD2L1Q9P0L9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PKD2L1Q9P0L9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PKD2L1Q9P0L9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PKD2L1Q9P0L9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PKD2L1Q9P0L9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PKD2L1Q9P0L9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PKD2L1Q9P0L9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PKD2L1Q9P0L9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PKD2L1Q9P0L9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PKD2L1Q9P0L9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PKD2L1Q9P0L9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PKD2L1Q9P0L9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PKD2L1Q9P0L9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PKD2L1Q9P0L9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PKD2L1Q9P0L9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PKD2L1Q9P0L9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PKD2L1Q9P0L9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PKD2L1Q9P0L9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■■□□ 2
PKD2L1Q9P0L9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PKD2L1Q9P0L9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PKD2L1Q9P0L9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PKD2L1Q9P0L9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PKD2L1Q9P0L9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PKD2L1Q9P0L9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PKD2L1Q9P0L9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PKD2L1Q9P0L9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PKD2L1Q9P0L9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PKD2L1Q9P0L9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PKD2L1Q9P0L9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PKD2L1Q9P0L9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PKD2L1Q9P0L9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PKD2L1Q9P0L9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PKD2L1Q9P0L9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PKD2L1Q9P0L9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PKD2L1Q9P0L9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PKD2L1Q9P0L9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PKD2L1Q9P0L9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PKD2L1Q9P0L9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PKD2L1Q9P0L9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PKD2L1Q9P0L9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PKD2L1Q9P0L9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PKD2L1Q9P0L9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PKD2L1Q9P0L9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PKD2L1Q9P0L9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PKD2L1Q9P0L9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PKD2L1Q9P0L9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PKD2L1Q9P0L9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PKD2L1Q9P0L9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms