Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHMP5Q9NZZ3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHMP5Q9NZZ3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHMP5Q9NZZ3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CHMP5Q9NZZ3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CHMP5Q9NZZ3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CHMP5Q9NZZ3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CHMP5Q9NZZ3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CHMP5Q9NZZ3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CHMP5Q9NZZ3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
CHMP5Q9NZZ3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CHMP5Q9NZZ3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CHMP5Q9NZZ3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CHMP5Q9NZZ3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CHMP5Q9NZZ3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CHMP5Q9NZZ3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CHMP5Q9NZZ3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CHMP5Q9NZZ3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CHMP5Q9NZZ3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CHMP5Q9NZZ3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CHMP5Q9NZZ3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CHMP5Q9NZZ3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CHMP5Q9NZZ3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CHMP5Q9NZZ3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHMP5Q9NZZ3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHMP5Q9NZZ3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHMP5Q9NZZ3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHMP5Q9NZZ3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHMP5Q9NZZ3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHMP5Q9NZZ3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHMP5Q9NZZ3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHMP5Q9NZZ3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHMP5Q9NZZ3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHMP5Q9NZZ3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHMP5Q9NZZ3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHMP5Q9NZZ3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CHMP5Q9NZZ3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CHMP5Q9NZZ3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
CHMP5Q9NZZ3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
CHMP5Q9NZZ3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CHMP5Q9NZZ3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CHMP5Q9NZZ3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CHMP5Q9NZZ3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CHMP5Q9NZZ3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CHMP5Q9NZZ3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CHMP5Q9NZZ3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CHMP5Q9NZZ3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CHMP5Q9NZZ3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHMP5Q9NZZ3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHMP5Q9NZZ3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHMP5Q9NZZ3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHMP5Q9NZZ3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHMP5Q9NZZ3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHMP5Q9NZZ3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHMP5Q9NZZ3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHMP5Q9NZZ3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHMP5Q9NZZ3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHMP5Q9NZZ3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHMP5Q9NZZ3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHMP5Q9NZZ3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHMP5Q9NZZ3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHMP5Q9NZZ3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHMP5Q9NZZ3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHMP5Q9NZZ3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHMP5Q9NZZ3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHMP5Q9NZZ3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHMP5Q9NZZ3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHMP5Q9NZZ3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHMP5Q9NZZ3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHMP5Q9NZZ3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHMP5Q9NZZ3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CHMP5Q9NZZ3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHMP5Q9NZZ3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHMP5Q9NZZ3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHMP5Q9NZZ3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHMP5Q9NZZ3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHMP5Q9NZZ3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHMP5Q9NZZ3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHMP5Q9NZZ3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHMP5Q9NZZ3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHMP5Q9NZZ3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHMP5Q9NZZ3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHMP5Q9NZZ3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CHMP5Q9NZZ3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHMP5Q9NZZ3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHMP5Q9NZZ3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHMP5Q9NZZ3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHMP5Q9NZZ3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHMP5Q9NZZ3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHMP5Q9NZZ3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHMP5Q9NZZ3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CHMP5Q9NZZ3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHMP5Q9NZZ3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHMP5Q9NZZ3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHMP5Q9NZZ3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHMP5Q9NZZ3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHMP5Q9NZZ3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHMP5Q9NZZ3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHMP5Q9NZZ3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHMP5Q9NZZ3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms