Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZV6

MSRB1, Methionine-R-sulfoxide reductase B1, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRB1Q9NZV6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MSRB1Q9NZV6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MSRB1Q9NZV6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MSRB1Q9NZV6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MSRB1Q9NZV6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MSRB1Q9NZV6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MSRB1Q9NZV6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MSRB1Q9NZV6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MSRB1Q9NZV6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MSRB1Q9NZV6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MSRB1Q9NZV6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
MSRB1Q9NZV6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MSRB1Q9NZV6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MSRB1Q9NZV6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MSRB1Q9NZV6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MSRB1Q9NZV6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MSRB1Q9NZV6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MSRB1Q9NZV6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MSRB1Q9NZV6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MSRB1Q9NZV6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MSRB1Q9NZV6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MSRB1Q9NZV6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MSRB1Q9NZV6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MSRB1Q9NZV6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MSRB1Q9NZV6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MSRB1Q9NZV6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MSRB1Q9NZV6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MSRB1Q9NZV6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MSRB1Q9NZV6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MSRB1Q9NZV6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MSRB1Q9NZV6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MSRB1Q9NZV6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MSRB1Q9NZV6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MSRB1Q9NZV6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MSRB1Q9NZV6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MSRB1Q9NZV6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MSRB1Q9NZV6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MSRB1Q9NZV6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MSRB1Q9NZV6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MSRB1Q9NZV6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MSRB1Q9NZV6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MSRB1Q9NZV6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MSRB1Q9NZV6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MSRB1Q9NZV6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MSRB1Q9NZV6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MSRB1Q9NZV6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MSRB1Q9NZV6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MSRB1Q9NZV6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MSRB1Q9NZV6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MSRB1Q9NZV6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MSRB1Q9NZV6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MSRB1Q9NZV6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MSRB1Q9NZV6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MSRB1Q9NZV6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MSRB1Q9NZV6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MSRB1Q9NZV6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MSRB1Q9NZV6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MSRB1Q9NZV6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MSRB1Q9NZV6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
MSRB1Q9NZV6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MSRB1Q9NZV6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MSRB1Q9NZV6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MSRB1Q9NZV6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MSRB1Q9NZV6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MSRB1Q9NZV6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
MSRB1Q9NZV6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MSRB1Q9NZV6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MSRB1Q9NZV6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
MSRB1Q9NZV6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MSRB1Q9NZV6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MSRB1Q9NZV6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MSRB1Q9NZV6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MSRB1Q9NZV6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MSRB1Q9NZV6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
MSRB1Q9NZV6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MSRB1Q9NZV6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MSRB1Q9NZV6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MSRB1Q9NZV6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MSRB1Q9NZV6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MSRB1Q9NZV6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MSRB1Q9NZV6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MSRB1Q9NZV6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MSRB1Q9NZV6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MSRB1Q9NZV6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MSRB1Q9NZV6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MSRB1Q9NZV6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MSRB1Q9NZV6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MSRB1Q9NZV6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MSRB1Q9NZV6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MSRB1Q9NZV6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MSRB1Q9NZV6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MSRB1Q9NZV6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MSRB1Q9NZV6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MSRB1Q9NZV6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MSRB1Q9NZV6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MSRB1Q9NZV6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MSRB1Q9NZV6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MSRB1Q9NZV6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MSRB1Q9NZV6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MSRB1Q9NZV6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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