Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYA3

GOLGA6A, Golgin subfamily A member 6A, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6AQ9NYA3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GOLGA6AQ9NYA3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GOLGA6AQ9NYA3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GOLGA6AQ9NYA3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GOLGA6AQ9NYA3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GOLGA6AQ9NYA3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GOLGA6AQ9NYA3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GOLGA6AQ9NYA3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GOLGA6AQ9NYA3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GOLGA6AQ9NYA3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GOLGA6AQ9NYA3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GOLGA6AQ9NYA3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GOLGA6AQ9NYA3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GOLGA6AQ9NYA3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GOLGA6AQ9NYA3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GOLGA6AQ9NYA3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GOLGA6AQ9NYA3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GOLGA6AQ9NYA3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GOLGA6AQ9NYA3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLGA6AQ9NYA3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLGA6AQ9NYA3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLGA6AQ9NYA3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLGA6AQ9NYA3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLGA6AQ9NYA3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLGA6AQ9NYA3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLGA6AQ9NYA3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLGA6AQ9NYA3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLGA6AQ9NYA3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLGA6AQ9NYA3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GOLGA6AQ9NYA3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GOLGA6AQ9NYA3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GOLGA6AQ9NYA3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GOLGA6AQ9NYA3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GOLGA6AQ9NYA3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GOLGA6AQ9NYA3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GOLGA6AQ9NYA3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GOLGA6AQ9NYA3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GOLGA6AQ9NYA3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GOLGA6AQ9NYA3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GOLGA6AQ9NYA3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GOLGA6AQ9NYA3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GOLGA6AQ9NYA3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GOLGA6AQ9NYA3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GOLGA6AQ9NYA3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
GOLGA6AQ9NYA3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GOLGA6AQ9NYA3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GOLGA6AQ9NYA3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GOLGA6AQ9NYA3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
GOLGA6AQ9NYA3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GOLGA6AQ9NYA3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GOLGA6AQ9NYA3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GOLGA6AQ9NYA3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GOLGA6AQ9NYA3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GOLGA6AQ9NYA3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GOLGA6AQ9NYA3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GOLGA6AQ9NYA3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GOLGA6AQ9NYA3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GOLGA6AQ9NYA3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GOLGA6AQ9NYA3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GOLGA6AQ9NYA3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GOLGA6AQ9NYA3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GOLGA6AQ9NYA3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GOLGA6AQ9NYA3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GOLGA6AQ9NYA3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GOLGA6AQ9NYA3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GOLGA6AQ9NYA3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GOLGA6AQ9NYA3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GOLGA6AQ9NYA3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GOLGA6AQ9NYA3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GOLGA6AQ9NYA3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GOLGA6AQ9NYA3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GOLGA6AQ9NYA3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GOLGA6AQ9NYA3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GOLGA6AQ9NYA3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GOLGA6AQ9NYA3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GOLGA6AQ9NYA3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GOLGA6AQ9NYA3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GOLGA6AQ9NYA3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GOLGA6AQ9NYA3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GOLGA6AQ9NYA3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GOLGA6AQ9NYA3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GOLGA6AQ9NYA3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GOLGA6AQ9NYA3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GOLGA6AQ9NYA3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GOLGA6AQ9NYA3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GOLGA6AQ9NYA3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GOLGA6AQ9NYA3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GOLGA6AQ9NYA3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GOLGA6AQ9NYA3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GOLGA6AQ9NYA3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GOLGA6AQ9NYA3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GOLGA6AQ9NYA3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GOLGA6AQ9NYA3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GOLGA6AQ9NYA3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GOLGA6AQ9NYA3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GOLGA6AQ9NYA3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GOLGA6AQ9NYA3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GOLGA6AQ9NYA3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GOLGA6AQ9NYA3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GOLGA6AQ9NYA3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms