Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXB0

MKS1, Meckel syndrome type 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKS1Q9NXB0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MKS1Q9NXB0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MKS1Q9NXB0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MKS1Q9NXB0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MKS1Q9NXB0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MKS1Q9NXB0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MKS1Q9NXB0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MKS1Q9NXB0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MKS1Q9NXB0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MKS1Q9NXB0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MKS1Q9NXB0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MKS1Q9NXB0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MKS1Q9NXB0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MKS1Q9NXB0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MKS1Q9NXB0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MKS1Q9NXB0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MKS1Q9NXB0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MKS1Q9NXB0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MKS1Q9NXB0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MKS1Q9NXB0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MKS1Q9NXB0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MKS1Q9NXB0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MKS1Q9NXB0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MKS1Q9NXB0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MKS1Q9NXB0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MKS1Q9NXB0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MKS1Q9NXB0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MKS1Q9NXB0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MKS1Q9NXB0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MKS1Q9NXB0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MKS1Q9NXB0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MKS1Q9NXB0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MKS1Q9NXB0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MKS1Q9NXB0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MKS1Q9NXB0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MKS1Q9NXB0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MKS1Q9NXB0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MKS1Q9NXB0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MKS1Q9NXB0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MKS1Q9NXB0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MKS1Q9NXB0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MKS1Q9NXB0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MKS1Q9NXB0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MKS1Q9NXB0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MKS1Q9NXB0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MKS1Q9NXB0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MKS1Q9NXB0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MKS1Q9NXB0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MKS1Q9NXB0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MKS1Q9NXB0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MKS1Q9NXB0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MKS1Q9NXB0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MKS1Q9NXB0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MKS1Q9NXB0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MKS1Q9NXB0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MKS1Q9NXB0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MKS1Q9NXB0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MKS1Q9NXB0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MKS1Q9NXB0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MKS1Q9NXB0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MKS1Q9NXB0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MKS1Q9NXB0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MKS1Q9NXB0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MKS1Q9NXB0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MKS1Q9NXB0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MKS1Q9NXB0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MKS1Q9NXB0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MKS1Q9NXB0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MKS1Q9NXB0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MKS1Q9NXB0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MKS1Q9NXB0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MKS1Q9NXB0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MKS1Q9NXB0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MKS1Q9NXB0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MKS1Q9NXB0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MKS1Q9NXB0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MKS1Q9NXB0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MKS1Q9NXB0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MKS1Q9NXB0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MKS1Q9NXB0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MKS1Q9NXB0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MKS1Q9NXB0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MKS1Q9NXB0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MKS1Q9NXB0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MKS1Q9NXB0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MKS1Q9NXB0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MKS1Q9NXB0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MKS1Q9NXB0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MKS1Q9NXB0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MKS1Q9NXB0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MKS1Q9NXB0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
MKS1Q9NXB0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MKS1Q9NXB0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MKS1Q9NXB0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MKS1Q9NXB0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MKS1Q9NXB0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MKS1Q9NXB0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MKS1Q9NXB0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MKS1Q9NXB0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MKS1Q9NXB0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms