Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TBCCD1Q9NVR7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TBCCD1Q9NVR7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TBCCD1Q9NVR7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TBCCD1Q9NVR7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TBCCD1Q9NVR7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TBCCD1Q9NVR7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TBCCD1Q9NVR7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TBCCD1Q9NVR7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TBCCD1Q9NVR7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TBCCD1Q9NVR7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TBCCD1Q9NVR7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TBCCD1Q9NVR7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TBCCD1Q9NVR7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TBCCD1Q9NVR7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TBCCD1Q9NVR7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TBCCD1Q9NVR7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TBCCD1Q9NVR7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TBCCD1Q9NVR7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TBCCD1Q9NVR7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TBCCD1Q9NVR7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TBCCD1Q9NVR7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TBCCD1Q9NVR7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TBCCD1Q9NVR7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TBCCD1Q9NVR7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TBCCD1Q9NVR7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TBCCD1Q9NVR7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TBCCD1Q9NVR7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TBCCD1Q9NVR7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TBCCD1Q9NVR7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TBCCD1Q9NVR7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TBCCD1Q9NVR7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TBCCD1Q9NVR7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TBCCD1Q9NVR7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TBCCD1Q9NVR7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TBCCD1Q9NVR7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TBCCD1Q9NVR7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TBCCD1Q9NVR7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TBCCD1Q9NVR7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TBCCD1Q9NVR7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TBCCD1Q9NVR7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TBCCD1Q9NVR7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TBCCD1Q9NVR7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TBCCD1Q9NVR7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TBCCD1Q9NVR7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TBCCD1Q9NVR7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TBCCD1Q9NVR7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TBCCD1Q9NVR7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TBCCD1Q9NVR7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TBCCD1Q9NVR7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TBCCD1Q9NVR7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TBCCD1Q9NVR7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TBCCD1Q9NVR7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TBCCD1Q9NVR7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TBCCD1Q9NVR7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TBCCD1Q9NVR7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TBCCD1Q9NVR7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TBCCD1Q9NVR7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TBCCD1Q9NVR7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TBCCD1Q9NVR7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TBCCD1Q9NVR7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TBCCD1Q9NVR7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TBCCD1Q9NVR7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TBCCD1Q9NVR7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TBCCD1Q9NVR7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TBCCD1Q9NVR7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TBCCD1Q9NVR7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TBCCD1Q9NVR7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TBCCD1Q9NVR7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TBCCD1Q9NVR7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TBCCD1Q9NVR7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TBCCD1Q9NVR7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TBCCD1Q9NVR7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TBCCD1Q9NVR7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TBCCD1Q9NVR7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TBCCD1Q9NVR7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TBCCD1Q9NVR7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TBCCD1Q9NVR7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TBCCD1Q9NVR7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TBCCD1Q9NVR7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TBCCD1Q9NVR7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TBCCD1Q9NVR7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TBCCD1Q9NVR7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TBCCD1Q9NVR7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TBCCD1Q9NVR7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TBCCD1Q9NVR7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TBCCD1Q9NVR7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TBCCD1Q9NVR7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TBCCD1Q9NVR7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TBCCD1Q9NVR7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TBCCD1Q9NVR7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TBCCD1Q9NVR7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TBCCD1Q9NVR7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TBCCD1Q9NVR7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TBCCD1Q9NVR7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TBCCD1Q9NVR7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TBCCD1Q9NVR7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TBCCD1Q9NVR7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TBCCD1Q9NVR7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TBCCD1Q9NVR7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms