Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVH1

DNAJC11, DnaJ homolog subfamily C member 11, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC11Q9NVH1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNAJC11Q9NVH1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNAJC11Q9NVH1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNAJC11Q9NVH1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DNAJC11Q9NVH1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DNAJC11Q9NVH1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
DNAJC11Q9NVH1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
DNAJC11Q9NVH1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DNAJC11Q9NVH1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DNAJC11Q9NVH1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNAJC11Q9NVH1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNAJC11Q9NVH1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNAJC11Q9NVH1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
DNAJC11Q9NVH1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNAJC11Q9NVH1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNAJC11Q9NVH1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNAJC11Q9NVH1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNAJC11Q9NVH1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNAJC11Q9NVH1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNAJC11Q9NVH1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNAJC11Q9NVH1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNAJC11Q9NVH1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNAJC11Q9NVH1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNAJC11Q9NVH1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNAJC11Q9NVH1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNAJC11Q9NVH1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNAJC11Q9NVH1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNAJC11Q9NVH1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNAJC11Q9NVH1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNAJC11Q9NVH1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNAJC11Q9NVH1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNAJC11Q9NVH1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNAJC11Q9NVH1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
DNAJC11Q9NVH1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNAJC11Q9NVH1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DNAJC11Q9NVH1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DNAJC11Q9NVH1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DNAJC11Q9NVH1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
DNAJC11Q9NVH1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DNAJC11Q9NVH1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
DNAJC11Q9NVH1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
DNAJC11Q9NVH1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
DNAJC11Q9NVH1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
DNAJC11Q9NVH1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNAJC11Q9NVH1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNAJC11Q9NVH1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNAJC11Q9NVH1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNAJC11Q9NVH1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNAJC11Q9NVH1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNAJC11Q9NVH1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNAJC11Q9NVH1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNAJC11Q9NVH1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAJC11Q9NVH1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAJC11Q9NVH1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAJC11Q9NVH1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAJC11Q9NVH1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAJC11Q9NVH1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAJC11Q9NVH1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAJC11Q9NVH1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAJC11Q9NVH1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNAJC11Q9NVH1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNAJC11Q9NVH1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNAJC11Q9NVH1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
DNAJC11Q9NVH1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNAJC11Q9NVH1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNAJC11Q9NVH1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNAJC11Q9NVH1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNAJC11Q9NVH1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
DNAJC11Q9NVH1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNAJC11Q9NVH1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
DNAJC11Q9NVH1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNAJC11Q9NVH1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNAJC11Q9NVH1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNAJC11Q9NVH1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNAJC11Q9NVH1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNAJC11Q9NVH1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNAJC11Q9NVH1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
DNAJC11Q9NVH1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNAJC11Q9NVH1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNAJC11Q9NVH1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNAJC11Q9NVH1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNAJC11Q9NVH1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNAJC11Q9NVH1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNAJC11Q9NVH1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNAJC11Q9NVH1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNAJC11Q9NVH1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNAJC11Q9NVH1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNAJC11Q9NVH1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNAJC11Q9NVH1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNAJC11Q9NVH1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNAJC11Q9NVH1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNAJC11Q9NVH1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNAJC11Q9NVH1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNAJC11Q9NVH1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
DNAJC11Q9NVH1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNAJC11Q9NVH1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNAJC11Q9NVH1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNAJC11Q9NVH1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNAJC11Q9NVH1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNAJC11Q9NVH1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms