Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS56

TOPORS, E3 ubiquitin-protein ligase Topors, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPORSQ9NS56 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TOPORSQ9NS56 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TOPORSQ9NS56 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TOPORSQ9NS56 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
TOPORSQ9NS56 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TOPORSQ9NS56 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
TOPORSQ9NS56 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TOPORSQ9NS56 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TOPORSQ9NS56 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TOPORSQ9NS56 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TOPORSQ9NS56 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TOPORSQ9NS56 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TOPORSQ9NS56 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TOPORSQ9NS56 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TOPORSQ9NS56 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TOPORSQ9NS56 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TOPORSQ9NS56 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TOPORSQ9NS56 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TOPORSQ9NS56 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TOPORSQ9NS56 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TOPORSQ9NS56 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TOPORSQ9NS56 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TOPORSQ9NS56 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TOPORSQ9NS56 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TOPORSQ9NS56 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TOPORSQ9NS56 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TOPORSQ9NS56 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TOPORSQ9NS56 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TOPORSQ9NS56 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TOPORSQ9NS56 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TOPORSQ9NS56 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TOPORSQ9NS56 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TOPORSQ9NS56 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TOPORSQ9NS56 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TOPORSQ9NS56 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TOPORSQ9NS56 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TOPORSQ9NS56 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TOPORSQ9NS56 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TOPORSQ9NS56 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TOPORSQ9NS56 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TOPORSQ9NS56 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TOPORSQ9NS56 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TOPORSQ9NS56 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TOPORSQ9NS56 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TOPORSQ9NS56 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TOPORSQ9NS56 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TOPORSQ9NS56 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TOPORSQ9NS56 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TOPORSQ9NS56 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TOPORSQ9NS56 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TOPORSQ9NS56 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TOPORSQ9NS56 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TOPORSQ9NS56 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TOPORSQ9NS56 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
TOPORSQ9NS56 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
TOPORSQ9NS56 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TOPORSQ9NS56 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TOPORSQ9NS56 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TOPORSQ9NS56 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TOPORSQ9NS56 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TOPORSQ9NS56 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TOPORSQ9NS56 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TOPORSQ9NS56 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TOPORSQ9NS56 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TOPORSQ9NS56 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TOPORSQ9NS56 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TOPORSQ9NS56 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TOPORSQ9NS56 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TOPORSQ9NS56 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TOPORSQ9NS56 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TOPORSQ9NS56 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TOPORSQ9NS56 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TOPORSQ9NS56 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TOPORSQ9NS56 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TOPORSQ9NS56 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TOPORSQ9NS56 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TOPORSQ9NS56 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
TOPORSQ9NS56 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TOPORSQ9NS56 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TOPORSQ9NS56 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TOPORSQ9NS56 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TOPORSQ9NS56 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TOPORSQ9NS56 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TOPORSQ9NS56 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TOPORSQ9NS56 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TOPORSQ9NS56 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TOPORSQ9NS56 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TOPORSQ9NS56 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TOPORSQ9NS56 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TOPORSQ9NS56 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TOPORSQ9NS56 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TOPORSQ9NS56 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TOPORSQ9NS56 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TOPORSQ9NS56 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TOPORSQ9NS56 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TOPORSQ9NS56 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TOPORSQ9NS56 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TOPORSQ9NS56 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TOPORSQ9NS56 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TOPORSQ9NS56 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 217.3 ms