Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA8

EIF4ENIF1, Eukaryotic translation initiation factor 4E transporter, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 985 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4ENIF1Q9NRA8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
EIF4ENIF1Q9NRA8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
EIF4ENIF1Q9NRA8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EIF4ENIF1Q9NRA8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
EIF4ENIF1Q9NRA8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EIF4ENIF1Q9NRA8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
EIF4ENIF1Q9NRA8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EIF4ENIF1Q9NRA8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
EIF4ENIF1Q9NRA8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
EIF4ENIF1Q9NRA8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EIF4ENIF1Q9NRA8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
EIF4ENIF1Q9NRA8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EIF4ENIF1Q9NRA8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
EIF4ENIF1Q9NRA8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
EIF4ENIF1Q9NRA8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EIF4ENIF1Q9NRA8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
EIF4ENIF1Q9NRA8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EIF4ENIF1Q9NRA8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
EIF4ENIF1Q9NRA8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EIF4ENIF1Q9NRA8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EIF4ENIF1Q9NRA8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EIF4ENIF1Q9NRA8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
EIF4ENIF1Q9NRA8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EIF4ENIF1Q9NRA8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
EIF4ENIF1Q9NRA8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EIF4ENIF1Q9NRA8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EIF4ENIF1Q9NRA8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
EIF4ENIF1Q9NRA8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
EIF4ENIF1Q9NRA8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
EIF4ENIF1Q9NRA8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
EIF4ENIF1Q9NRA8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
EIF4ENIF1Q9NRA8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
EIF4ENIF1Q9NRA8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
EIF4ENIF1Q9NRA8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
EIF4ENIF1Q9NRA8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
EIF4ENIF1Q9NRA8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
EIF4ENIF1Q9NRA8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
EIF4ENIF1Q9NRA8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
EIF4ENIF1Q9NRA8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
EIF4ENIF1Q9NRA8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
EIF4ENIF1Q9NRA8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
EIF4ENIF1Q9NRA8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
EIF4ENIF1Q9NRA8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EIF4ENIF1Q9NRA8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EIF4ENIF1Q9NRA8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EIF4ENIF1Q9NRA8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EIF4ENIF1Q9NRA8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EIF4ENIF1Q9NRA8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EIF4ENIF1Q9NRA8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
EIF4ENIF1Q9NRA8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
EIF4ENIF1Q9NRA8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EIF4ENIF1Q9NRA8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EIF4ENIF1Q9NRA8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
EIF4ENIF1Q9NRA8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
EIF4ENIF1Q9NRA8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
EIF4ENIF1Q9NRA8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
EIF4ENIF1Q9NRA8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
EIF4ENIF1Q9NRA8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
EIF4ENIF1Q9NRA8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
EIF4ENIF1Q9NRA8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
EIF4ENIF1Q9NRA8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
EIF4ENIF1Q9NRA8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
EIF4ENIF1Q9NRA8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
EIF4ENIF1Q9NRA8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
EIF4ENIF1Q9NRA8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
EIF4ENIF1Q9NRA8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
EIF4ENIF1Q9NRA8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
EIF4ENIF1Q9NRA8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
EIF4ENIF1Q9NRA8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EIF4ENIF1Q9NRA8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
EIF4ENIF1Q9NRA8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EIF4ENIF1Q9NRA8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EIF4ENIF1Q9NRA8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
EIF4ENIF1Q9NRA8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
EIF4ENIF1Q9NRA8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
EIF4ENIF1Q9NRA8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
EIF4ENIF1Q9NRA8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
EIF4ENIF1Q9NRA8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
EIF4ENIF1Q9NRA8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
EIF4ENIF1Q9NRA8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
EIF4ENIF1Q9NRA8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
EIF4ENIF1Q9NRA8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
EIF4ENIF1Q9NRA8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
EIF4ENIF1Q9NRA8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
EIF4ENIF1Q9NRA8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
EIF4ENIF1Q9NRA8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
EIF4ENIF1Q9NRA8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms