Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR19

ACSS2, Acetyl-coenzyme A synthetase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSS2Q9NR19 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACSS2Q9NR19 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACSS2Q9NR19 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACSS2Q9NR19 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACSS2Q9NR19 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACSS2Q9NR19 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACSS2Q9NR19 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACSS2Q9NR19 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACSS2Q9NR19 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACSS2Q9NR19 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACSS2Q9NR19 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACSS2Q9NR19 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACSS2Q9NR19 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ACSS2Q9NR19 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACSS2Q9NR19 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACSS2Q9NR19 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACSS2Q9NR19 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACSS2Q9NR19 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACSS2Q9NR19 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ACSS2Q9NR19 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACSS2Q9NR19 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACSS2Q9NR19 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ACSS2Q9NR19 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACSS2Q9NR19 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACSS2Q9NR19 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACSS2Q9NR19 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACSS2Q9NR19 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACSS2Q9NR19 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACSS2Q9NR19 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACSS2Q9NR19 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACSS2Q9NR19 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACSS2Q9NR19 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACSS2Q9NR19 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACSS2Q9NR19 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACSS2Q9NR19 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACSS2Q9NR19 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACSS2Q9NR19 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACSS2Q9NR19 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACSS2Q9NR19 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACSS2Q9NR19 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACSS2Q9NR19 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACSS2Q9NR19 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACSS2Q9NR19 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACSS2Q9NR19 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACSS2Q9NR19 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACSS2Q9NR19 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACSS2Q9NR19 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACSS2Q9NR19 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACSS2Q9NR19 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACSS2Q9NR19 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACSS2Q9NR19 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACSS2Q9NR19 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ACSS2Q9NR19 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACSS2Q9NR19 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACSS2Q9NR19 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACSS2Q9NR19 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ACSS2Q9NR19 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACSS2Q9NR19 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACSS2Q9NR19 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACSS2Q9NR19 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACSS2Q9NR19 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACSS2Q9NR19 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACSS2Q9NR19 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACSS2Q9NR19 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACSS2Q9NR19 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACSS2Q9NR19 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACSS2Q9NR19 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACSS2Q9NR19 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACSS2Q9NR19 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACSS2Q9NR19 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACSS2Q9NR19 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACSS2Q9NR19 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACSS2Q9NR19 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACSS2Q9NR19 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACSS2Q9NR19 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.43
ACSS2Q9NR19 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACSS2Q9NR19 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACSS2Q9NR19 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ACSS2Q9NR19 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACSS2Q9NR19 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACSS2Q9NR19 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ACSS2Q9NR19 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ACSS2Q9NR19 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ACSS2Q9NR19 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ACSS2Q9NR19 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ACSS2Q9NR19 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ACSS2Q9NR19 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ACSS2Q9NR19 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ACSS2Q9NR19 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACSS2Q9NR19 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACSS2Q9NR19 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACSS2Q9NR19 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACSS2Q9NR19 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACSS2Q9NR19 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACSS2Q9NR19 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACSS2Q9NR19 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ACSS2Q9NR19 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACSS2Q9NR19 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACSS2Q9NR19 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACSS2Q9NR19 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.4 ms