Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEMA4BQ9NPR2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEMA4BQ9NPR2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEMA4BQ9NPR2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEMA4BQ9NPR2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEMA4BQ9NPR2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEMA4BQ9NPR2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SEMA4BQ9NPR2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEMA4BQ9NPR2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEMA4BQ9NPR2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEMA4BQ9NPR2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEMA4BQ9NPR2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEMA4BQ9NPR2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEMA4BQ9NPR2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEMA4BQ9NPR2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEMA4BQ9NPR2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SEMA4BQ9NPR2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEMA4BQ9NPR2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEMA4BQ9NPR2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEMA4BQ9NPR2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEMA4BQ9NPR2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEMA4BQ9NPR2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEMA4BQ9NPR2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEMA4BQ9NPR2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEMA4BQ9NPR2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEMA4BQ9NPR2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEMA4BQ9NPR2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEMA4BQ9NPR2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEMA4BQ9NPR2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEMA4BQ9NPR2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEMA4BQ9NPR2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEMA4BQ9NPR2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEMA4BQ9NPR2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEMA4BQ9NPR2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEMA4BQ9NPR2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEMA4BQ9NPR2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEMA4BQ9NPR2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEMA4BQ9NPR2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA4BQ9NPR2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA4BQ9NPR2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA4BQ9NPR2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA4BQ9NPR2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA4BQ9NPR2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA4BQ9NPR2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEMA4BQ9NPR2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEMA4BQ9NPR2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEMA4BQ9NPR2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEMA4BQ9NPR2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEMA4BQ9NPR2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEMA4BQ9NPR2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SEMA4BQ9NPR2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SEMA4BQ9NPR2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SEMA4BQ9NPR2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA4BQ9NPR2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA4BQ9NPR2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA4BQ9NPR2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA4BQ9NPR2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA4BQ9NPR2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA4BQ9NPR2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA4BQ9NPR2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA4BQ9NPR2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEMA4BQ9NPR2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEMA4BQ9NPR2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEMA4BQ9NPR2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA4BQ9NPR2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA4BQ9NPR2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA4BQ9NPR2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA4BQ9NPR2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA4BQ9NPR2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA4BQ9NPR2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA4BQ9NPR2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA4BQ9NPR2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA4BQ9NPR2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA4BQ9NPR2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA4BQ9NPR2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA4BQ9NPR2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEMA4BQ9NPR2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEMA4BQ9NPR2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEMA4BQ9NPR2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEMA4BQ9NPR2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SEMA4BQ9NPR2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEMA4BQ9NPR2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEMA4BQ9NPR2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEMA4BQ9NPR2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEMA4BQ9NPR2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEMA4BQ9NPR2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEMA4BQ9NPR2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEMA4BQ9NPR2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEMA4BQ9NPR2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEMA4BQ9NPR2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEMA4BQ9NPR2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEMA4BQ9NPR2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEMA4BQ9NPR2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEMA4BQ9NPR2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEMA4BQ9NPR2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEMA4BQ9NPR2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEMA4BQ9NPR2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEMA4BQ9NPR2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEMA4BQ9NPR2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEMA4BQ9NPR2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms