Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FZD3Q9NPG1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FZD3Q9NPG1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
FZD3Q9NPG1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FZD3Q9NPG1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FZD3Q9NPG1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FZD3Q9NPG1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FZD3Q9NPG1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FZD3Q9NPG1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FZD3Q9NPG1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FZD3Q9NPG1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FZD3Q9NPG1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
FZD3Q9NPG1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FZD3Q9NPG1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FZD3Q9NPG1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FZD3Q9NPG1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
FZD3Q9NPG1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FZD3Q9NPG1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FZD3Q9NPG1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FZD3Q9NPG1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FZD3Q9NPG1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FZD3Q9NPG1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FZD3Q9NPG1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FZD3Q9NPG1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FZD3Q9NPG1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FZD3Q9NPG1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FZD3Q9NPG1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FZD3Q9NPG1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FZD3Q9NPG1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FZD3Q9NPG1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FZD3Q9NPG1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FZD3Q9NPG1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FZD3Q9NPG1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FZD3Q9NPG1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FZD3Q9NPG1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FZD3Q9NPG1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FZD3Q9NPG1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FZD3Q9NPG1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FZD3Q9NPG1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FZD3Q9NPG1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FZD3Q9NPG1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FZD3Q9NPG1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FZD3Q9NPG1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FZD3Q9NPG1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FZD3Q9NPG1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FZD3Q9NPG1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FZD3Q9NPG1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FZD3Q9NPG1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FZD3Q9NPG1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FZD3Q9NPG1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FZD3Q9NPG1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FZD3Q9NPG1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
FZD3Q9NPG1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FZD3Q9NPG1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FZD3Q9NPG1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FZD3Q9NPG1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FZD3Q9NPG1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FZD3Q9NPG1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FZD3Q9NPG1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FZD3Q9NPG1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FZD3Q9NPG1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FZD3Q9NPG1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FZD3Q9NPG1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
FZD3Q9NPG1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FZD3Q9NPG1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FZD3Q9NPG1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FZD3Q9NPG1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FZD3Q9NPG1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FZD3Q9NPG1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FZD3Q9NPG1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FZD3Q9NPG1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FZD3Q9NPG1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FZD3Q9NPG1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FZD3Q9NPG1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FZD3Q9NPG1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FZD3Q9NPG1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FZD3Q9NPG1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FZD3Q9NPG1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FZD3Q9NPG1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
FZD3Q9NPG1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FZD3Q9NPG1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FZD3Q9NPG1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FZD3Q9NPG1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FZD3Q9NPG1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FZD3Q9NPG1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FZD3Q9NPG1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FZD3Q9NPG1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FZD3Q9NPG1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FZD3Q9NPG1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FZD3Q9NPG1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FZD3Q9NPG1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FZD3Q9NPG1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FZD3Q9NPG1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FZD3Q9NPG1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FZD3Q9NPG1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FZD3Q9NPG1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FZD3Q9NPG1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FZD3Q9NPG1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FZD3Q9NPG1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FZD3Q9NPG1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms