Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU4

SMURF2, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF2, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF2Q9HAU4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMURF2Q9HAU4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMURF2Q9HAU4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMURF2Q9HAU4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMURF2Q9HAU4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMURF2Q9HAU4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMURF2Q9HAU4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMURF2Q9HAU4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMURF2Q9HAU4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMURF2Q9HAU4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMURF2Q9HAU4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SMURF2Q9HAU4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMURF2Q9HAU4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMURF2Q9HAU4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMURF2Q9HAU4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMURF2Q9HAU4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SMURF2Q9HAU4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SMURF2Q9HAU4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SMURF2Q9HAU4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMURF2Q9HAU4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMURF2Q9HAU4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMURF2Q9HAU4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SMURF2Q9HAU4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMURF2Q9HAU4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMURF2Q9HAU4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMURF2Q9HAU4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMURF2Q9HAU4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SMURF2Q9HAU4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMURF2Q9HAU4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMURF2Q9HAU4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SMURF2Q9HAU4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMURF2Q9HAU4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMURF2Q9HAU4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMURF2Q9HAU4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMURF2Q9HAU4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMURF2Q9HAU4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SMURF2Q9HAU4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMURF2Q9HAU4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMURF2Q9HAU4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SMURF2Q9HAU4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMURF2Q9HAU4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMURF2Q9HAU4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMURF2Q9HAU4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMURF2Q9HAU4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMURF2Q9HAU4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMURF2Q9HAU4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMURF2Q9HAU4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMURF2Q9HAU4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMURF2Q9HAU4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMURF2Q9HAU4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMURF2Q9HAU4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMURF2Q9HAU4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMURF2Q9HAU4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMURF2Q9HAU4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMURF2Q9HAU4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMURF2Q9HAU4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMURF2Q9HAU4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMURF2Q9HAU4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMURF2Q9HAU4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMURF2Q9HAU4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMURF2Q9HAU4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMURF2Q9HAU4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMURF2Q9HAU4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMURF2Q9HAU4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMURF2Q9HAU4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMURF2Q9HAU4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMURF2Q9HAU4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMURF2Q9HAU4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMURF2Q9HAU4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMURF2Q9HAU4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMURF2Q9HAU4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMURF2Q9HAU4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMURF2Q9HAU4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMURF2Q9HAU4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMURF2Q9HAU4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMURF2Q9HAU4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMURF2Q9HAU4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMURF2Q9HAU4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMURF2Q9HAU4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMURF2Q9HAU4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMURF2Q9HAU4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SMURF2Q9HAU4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMURF2Q9HAU4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMURF2Q9HAU4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMURF2Q9HAU4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMURF2Q9HAU4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMURF2Q9HAU4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMURF2Q9HAU4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMURF2Q9HAU4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMURF2Q9HAU4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMURF2Q9HAU4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMURF2Q9HAU4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMURF2Q9HAU4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMURF2Q9HAU4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMURF2Q9HAU4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMURF2Q9HAU4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMURF2Q9HAU4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMURF2Q9HAU4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMURF2Q9HAU4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMURF2Q9HAU4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms