Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB8

PPCS, Phosphopantothenate--cysteine ligase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPCSQ9HAB8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPCSQ9HAB8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PPCSQ9HAB8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
PPCSQ9HAB8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPCSQ9HAB8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPCSQ9HAB8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPCSQ9HAB8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPCSQ9HAB8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPCSQ9HAB8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPCSQ9HAB8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPCSQ9HAB8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPCSQ9HAB8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPCSQ9HAB8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPCSQ9HAB8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPCSQ9HAB8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPCSQ9HAB8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPCSQ9HAB8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPCSQ9HAB8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPCSQ9HAB8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPCSQ9HAB8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPCSQ9HAB8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPCSQ9HAB8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPCSQ9HAB8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPCSQ9HAB8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PPCSQ9HAB8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPCSQ9HAB8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPCSQ9HAB8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPCSQ9HAB8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPCSQ9HAB8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPCSQ9HAB8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPCSQ9HAB8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPCSQ9HAB8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPCSQ9HAB8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPCSQ9HAB8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPCSQ9HAB8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPCSQ9HAB8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPCSQ9HAB8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPCSQ9HAB8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPCSQ9HAB8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPCSQ9HAB8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPCSQ9HAB8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PPCSQ9HAB8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PPCSQ9HAB8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PPCSQ9HAB8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PPCSQ9HAB8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PPCSQ9HAB8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PPCSQ9HAB8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PPCSQ9HAB8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PPCSQ9HAB8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PPCSQ9HAB8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPCSQ9HAB8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPCSQ9HAB8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPCSQ9HAB8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPCSQ9HAB8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPCSQ9HAB8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPCSQ9HAB8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPCSQ9HAB8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PPCSQ9HAB8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPCSQ9HAB8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPCSQ9HAB8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPCSQ9HAB8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPCSQ9HAB8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPCSQ9HAB8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPCSQ9HAB8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPCSQ9HAB8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPCSQ9HAB8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPCSQ9HAB8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPCSQ9HAB8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPCSQ9HAB8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPCSQ9HAB8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPCSQ9HAB8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPCSQ9HAB8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPCSQ9HAB8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPCSQ9HAB8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPCSQ9HAB8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPCSQ9HAB8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPCSQ9HAB8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPCSQ9HAB8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPCSQ9HAB8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPCSQ9HAB8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPCSQ9HAB8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPCSQ9HAB8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPCSQ9HAB8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPCSQ9HAB8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPCSQ9HAB8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PPCSQ9HAB8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPCSQ9HAB8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPCSQ9HAB8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPCSQ9HAB8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPCSQ9HAB8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPCSQ9HAB8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPCSQ9HAB8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPCSQ9HAB8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPCSQ9HAB8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPCSQ9HAB8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPCSQ9HAB8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPCSQ9HAB8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPCSQ9HAB8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPCSQ9HAB8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPCSQ9HAB8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms