Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3S1

SEMA4A, Semaphorin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4AQ9H3S1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SEMA4AQ9H3S1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SEMA4AQ9H3S1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SEMA4AQ9H3S1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SEMA4AQ9H3S1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SEMA4AQ9H3S1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SEMA4AQ9H3S1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SEMA4AQ9H3S1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEMA4AQ9H3S1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEMA4AQ9H3S1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SEMA4AQ9H3S1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SEMA4AQ9H3S1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SEMA4AQ9H3S1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SEMA4AQ9H3S1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SEMA4AQ9H3S1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SEMA4AQ9H3S1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SEMA4AQ9H3S1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SEMA4AQ9H3S1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SEMA4AQ9H3S1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SEMA4AQ9H3S1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SEMA4AQ9H3S1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SEMA4AQ9H3S1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SEMA4AQ9H3S1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEMA4AQ9H3S1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEMA4AQ9H3S1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEMA4AQ9H3S1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEMA4AQ9H3S1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SEMA4AQ9H3S1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SEMA4AQ9H3S1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SEMA4AQ9H3S1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SEMA4AQ9H3S1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
SEMA4AQ9H3S1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SEMA4AQ9H3S1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SEMA4AQ9H3S1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SEMA4AQ9H3S1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SEMA4AQ9H3S1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SEMA4AQ9H3S1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SEMA4AQ9H3S1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SEMA4AQ9H3S1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SEMA4AQ9H3S1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SEMA4AQ9H3S1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SEMA4AQ9H3S1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SEMA4AQ9H3S1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SEMA4AQ9H3S1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SEMA4AQ9H3S1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SEMA4AQ9H3S1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SEMA4AQ9H3S1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SEMA4AQ9H3S1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SEMA4AQ9H3S1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SEMA4AQ9H3S1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SEMA4AQ9H3S1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SEMA4AQ9H3S1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SEMA4AQ9H3S1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SEMA4AQ9H3S1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SEMA4AQ9H3S1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SEMA4AQ9H3S1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SEMA4AQ9H3S1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SEMA4AQ9H3S1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SEMA4AQ9H3S1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SEMA4AQ9H3S1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SEMA4AQ9H3S1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SEMA4AQ9H3S1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SEMA4AQ9H3S1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SEMA4AQ9H3S1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SEMA4AQ9H3S1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SEMA4AQ9H3S1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SEMA4AQ9H3S1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SEMA4AQ9H3S1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SEMA4AQ9H3S1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SEMA4AQ9H3S1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SEMA4AQ9H3S1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SEMA4AQ9H3S1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SEMA4AQ9H3S1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SEMA4AQ9H3S1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SEMA4AQ9H3S1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SEMA4AQ9H3S1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SEMA4AQ9H3S1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SEMA4AQ9H3S1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SEMA4AQ9H3S1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SEMA4AQ9H3S1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SEMA4AQ9H3S1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SEMA4AQ9H3S1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SEMA4AQ9H3S1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SEMA4AQ9H3S1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SEMA4AQ9H3S1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SEMA4AQ9H3S1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SEMA4AQ9H3S1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SEMA4AQ9H3S1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SEMA4AQ9H3S1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SEMA4AQ9H3S1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SEMA4AQ9H3S1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SEMA4AQ9H3S1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SEMA4AQ9H3S1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SEMA4AQ9H3S1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SEMA4AQ9H3S1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SEMA4AQ9H3S1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SEMA4AQ9H3S1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SEMA4AQ9H3S1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SEMA4AQ9H3S1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SEMA4AQ9H3S1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms