Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SHARPINQ9H0F6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SHARPINQ9H0F6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SHARPINQ9H0F6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SHARPINQ9H0F6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SHARPINQ9H0F6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SHARPINQ9H0F6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SHARPINQ9H0F6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SHARPINQ9H0F6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SHARPINQ9H0F6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SHARPINQ9H0F6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SHARPINQ9H0F6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SHARPINQ9H0F6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SHARPINQ9H0F6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SHARPINQ9H0F6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SHARPINQ9H0F6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SHARPINQ9H0F6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SHARPINQ9H0F6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SHARPINQ9H0F6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SHARPINQ9H0F6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SHARPINQ9H0F6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SHARPINQ9H0F6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHARPINQ9H0F6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHARPINQ9H0F6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHARPINQ9H0F6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHARPINQ9H0F6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHARPINQ9H0F6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHARPINQ9H0F6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHARPINQ9H0F6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHARPINQ9H0F6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHARPINQ9H0F6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHARPINQ9H0F6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHARPINQ9H0F6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHARPINQ9H0F6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHARPINQ9H0F6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHARPINQ9H0F6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHARPINQ9H0F6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHARPINQ9H0F6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHARPINQ9H0F6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHARPINQ9H0F6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHARPINQ9H0F6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHARPINQ9H0F6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHARPINQ9H0F6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SHARPINQ9H0F6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SHARPINQ9H0F6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SHARPINQ9H0F6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SHARPINQ9H0F6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SHARPINQ9H0F6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms