Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SHARPINQ9H0F6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SHARPINQ9H0F6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SHARPINQ9H0F6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SHARPINQ9H0F6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SHARPINQ9H0F6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SHARPINQ9H0F6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SHARPINQ9H0F6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SHARPINQ9H0F6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SHARPINQ9H0F6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SHARPINQ9H0F6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SHARPINQ9H0F6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SHARPINQ9H0F6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SHARPINQ9H0F6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SHARPINQ9H0F6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SHARPINQ9H0F6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SHARPINQ9H0F6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SHARPINQ9H0F6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SHARPINQ9H0F6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SHARPINQ9H0F6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SHARPINQ9H0F6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SHARPINQ9H0F6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHARPINQ9H0F6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHARPINQ9H0F6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHARPINQ9H0F6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHARPINQ9H0F6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHARPINQ9H0F6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHARPINQ9H0F6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHARPINQ9H0F6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHARPINQ9H0F6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHARPINQ9H0F6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHARPINQ9H0F6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHARPINQ9H0F6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHARPINQ9H0F6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHARPINQ9H0F6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHARPINQ9H0F6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHARPINQ9H0F6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHARPINQ9H0F6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHARPINQ9H0F6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHARPINQ9H0F6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHARPINQ9H0F6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHARPINQ9H0F6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHARPINQ9H0F6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SHARPINQ9H0F6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SHARPINQ9H0F6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SHARPINQ9H0F6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SHARPINQ9H0F6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SHARPINQ9H0F6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SHARPINQ9H0F6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms